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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1srh | ||||||
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タイトル | STRUCTURE-BASED DESIGN OF SYNTHETIC AZOBENZENE LIGANDS FOR STREPTAVIDIN | ||||||
![]() | STREPTAVIDIN | ||||||
![]() | BIOTIN-BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Weber, P.C. / Salemme, F.R. | ||||||
![]() | ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 1994 タイトル: Structure-Based Design of Synthetic Azobenzene Ligands for Streptavidin 著者: Weber, P.C. / Pantoliano, M.W. / Simons, D.M. / Salemme, F.R. #1: ![]() タイトル: Crystallographic and Thermodynamic Comparison of Natural and Synthetic Ligands Bound to Streptavidin 著者: Weber, P.C. / Wendoloski, J.J. / Pantoliano, M.W. / Salemme, F.R. #2: ![]() タイトル: Structural Origins of High-Affinity Biotin Binding to Streptavidin 著者: Weber, P.C. / Ohlendorf, D.H. / Wendoloski, J.J. / Salemme, F.R. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 58.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 42.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 491.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 501.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 12.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12738.730 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 参照: UniProt: P22629 #2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.3 Å3/Da / 溶媒含有率: 46.54 % | ||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 30 ℃ / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.2 Å / Num. obs: 14498 / Num. measured all: 62676 / Rmerge(I) obs: 0.059 |
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解析
ソフトウェア | 名称: PROLSQ / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2.2→10 Å / σ(F): 1 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→10 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: PROLSQ/PROFFT / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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