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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1spb | ||||||
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タイトル | SUBTILISIN BPN' PROSEGMENT (77 RESIDUES) COMPLEXED WITH A MUTANT SUBTILISIN BPN' (266 RESIDUES). CRYSTAL PH 4.6. CRYSTALLIZATION TEMPERATURE 20 C DIFFRACTION TEMPERATURE-160 C | ||||||
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![]() | COMPLEX (SERINE PROTEINASE/PROSEGMENT) / PROPEPTIDE / FOLDASE / FOLDING CATALYST / ACTIVATION DOMAIN / COMPLEX (SERINE PROTEINASE-PROSEGMENT) COMPLEX | ||||||
機能・相同性 | ![]() subtilisin / sporulation resulting in formation of a cellular spore / fibrinolysis / serine-type endopeptidase activity / proteolysis / extracellular region / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Gallagher, D.T. / Gilliland, G.L. / Wang, L. / Bryan, P.N. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The prosegment-subtilisin BPN' complex: crystal structure of a specific 'foldase'. 著者: Gallagher, T. / Gilliland, G. / Wang, L. / Bryan, P. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 80.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 58.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 381.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 407.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 11.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 17.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO S 168 | ||||||||
Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 8523.699 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: タンパク質 | 分子量: 26620.510 Da / 分子数: 1 Mutation: D32N, K43N, M50F, A73L, DEL(75-83), Q206V, Y217K, N218S, S221A 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 発現宿主: ![]() ![]() |
#3: 化合物 | ChemComp-NA / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.36 Å3/Da / 溶媒含有率: 47.98 % | |||||||||||||||
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結晶化 | pH: 4.6 / 詳細: pH 4.6 | |||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | |||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 113 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | 検出器: CCD / 日付: 1994年6月21日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 17956 / % possible obs: 84 % / 冗長度: 4.25 % / Rmerge(I) obs: 0.08 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2 Å / Rmerge(I) obs: 0.08 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2→8 Å / σ(F): 2 /
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原子変位パラメータ | Biso mean: 11.3 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: PROLSQ / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |