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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1skt | ||||||
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タイトル | SOLUTION STRUCTURE OF APO N-DOMAIN OF TROPONIN C, NMR, 40 STRUCTURES | ||||||
要素 | TROPONIN-C | ||||||
キーワード | CALCIUM-BINDING PROTEIN / EF-HAND / LOW-TEMPERATURE | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 troponin complex / Striated Muscle Contraction / myosin II complex / skeletal muscle contraction / calcium ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Gallus gallus (ニワトリ) | ||||||
手法 | 溶液NMR / DISGEO,SA | ||||||
データ登録者 | Tsuda, S. / Miura, A. / Gagne, S.M. / Spyracopoulos, L. / Sykes, B.D. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 1999 タイトル: Low-temperature-induced structural changes in the Apo regulatory domain of skeletal muscle troponin C. 著者: Tsuda, S. / Miura, A. / Gagne, S.M. / Spyracopoulos, L. / Sykes, B.D. #1: ジャーナル: To be Published タイトル: Low Temperature Effect on Dynamics of Apo N-Domain of Troponin C 著者: Tsuda, S. / Gagne, S.M. / Spyracopoulos, L. / Sykes, B.D. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1skt.cif.gz | 1 MB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1skt.ent.gz | 872.6 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1skt.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1skt_validation.pdf.gz | 341.6 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1skt_full_validation.pdf.gz | 700.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1skt_validation.xml.gz | 85.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1skt_validation.cif.gz | 128.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sk/1skt ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sk/1skt | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 9984.085 Da / 分子数: 1 / 断片: N-DOMAIN, RESIDUES 1-90 / 由来タイプ: 組換発現 詳細: RESIDUES 1-90 OF CHICKEN SKELETAL MUSCLE TROPONIN C IN CA2+-FREE STATE 由来: (組換発現) Gallus gallus (ニワトリ) / 組織: SKELETON / 遺伝子: NTNC / 器官: SKELETAL / プラスミド: PET3A / 遺伝子 (発現宿主): NTNC / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P02588 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: THE STRUCTURE WAS DETERMINED USING TRIPLE-RESONANCE NMR SPECTROSCOPY ON 13C,15N-LABELED APO NTNC. |
-試料調製
詳細 | 内容: WATER |
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試料状態 | イオン強度: 50mM KCL / pH: 6.7 / 圧: 1 atm / 温度: 277 K |
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
ソフトウェア |
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NMR software |
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精密化 | 手法: DISGEO,SA / ソフトェア番号: 1 詳細: REFINEMENT DETAILS CAN BE FOUND IN THE JRNL CITATION ABOVE. | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LEAST RESTRAINT VIOLATION 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 40 |