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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1sfw | ||||||
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タイトル | PORCINE PANCREAS PHOSPHOLIPASE A2, NMR, 18 STRUCTURES | ||||||
要素 | PHOSPHOLIPASE A2ホスホリパーゼA2 | ||||||
キーワード | HYDROLASE (加水分解酵素) / PHOSPHOLIPASE A2 (ホスホリパーゼA2) / PHOSPHATIDE-2-ACYL-HYDROLASE | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 Acyl chain remodelling of PC / Acyl chain remodelling of PS / Acyl chain remodelling of PE / Acyl chain remodelling of PI / Acyl chain remodelling of PG / Synthesis of PA / positive regulation of podocyte apoptotic process / regulation of glucose import / phosphatidylglycerol metabolic process / calcium-dependent phospholipase A2 activity ...Acyl chain remodelling of PC / Acyl chain remodelling of PS / Acyl chain remodelling of PE / Acyl chain remodelling of PI / Acyl chain remodelling of PG / Synthesis of PA / positive regulation of podocyte apoptotic process / regulation of glucose import / phosphatidylglycerol metabolic process / calcium-dependent phospholipase A2 activity / phosphatidylcholine metabolic process / leukotriene biosynthetic process / neutrophil mediated immunity / ホスホリパーゼA2 / bile acid binding / phospholipase A2 activity / positive regulation of calcium ion transport into cytosol / phospholipid metabolic process / lipid catabolic process / 好中球 / positive regulation of interleukin-8 production / phospholipid binding / positive regulation of MAP kinase activity / cellular response to insulin stimulus / fatty acid biosynthetic process / positive regulation of fibroblast proliferation / positive regulation of immune response / positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity / intracellular signal transduction / signaling receptor binding / calcium ion binding / positive regulation of cell population proliferation / 細胞膜 / positive regulation of transcription by RNA polymerase II / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Sus scrofa (ブタ) | ||||||
手法 | 溶液NMR | ||||||
データ登録者 | Van Den Berg, B. / Tessari, M. / Boelens, R. / Dijkman, R. / Kaptein, R. / De Haas, G.H. / Verheij, H.M. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Biomol.NMR / 年: 1995 タイトル: Solution structure of porcine pancreatic phospholipase A2 complexed with micelles and a competitive inhibitor. 著者: van den Berg, B. / Tessari, M. / Boelens, R. / Dijkman, R. / Kaptein, R. / de Haas, G.H. / Verheij, H.M. #1: ジャーナル: Embo J. / 年: 1995 タイトル: Solution Structure of Porcine Pancreatic Phospholipase A2 著者: Van Den Berg, B. / Tessari, M. / De Haas, G.H. / Verheij, H.M. / Boelens, R. / Kaptein, R. #2: ジャーナル: Nat.Struct.Biol. / 年: 1995 タイトル: NMR Structures of Phospholipase A2 Reveal Conformational Changes During Interfacial Activation 著者: Van Den Berg, B. / Tessari, M. / Boelens, R. / Dijkman, R. / De Haas, G.H. / Kaptein, R. / Verheij, H.M. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1sfw.cif.gz | 366.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1sfw.ent.gz | 298.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1sfw.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sf/1sfw ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sf/1sfw | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14009.714 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 詳細: THIS ENTRY PRESENTS THE SOLUTION STRUCTURE OF THE ENZYME IN THE PRESENCE OF LIPID MICELLES AND A COMPETITIVE INHIBITOR 由来: (組換発現) Sus scrofa (ブタ) 解説: DETAILS CONCERNING THE EXPRESSION OF THE PLA2 CAN BE FOUND IN REFERENCES BELOW 遺伝子: PORCINE PANCREAS PLA2 / 器官: PANCREAS膵臓 / プラスミド: PAB3 (PGEX T2 DERIVED EXPRESSION PLASMID) / 遺伝子 (発現宿主): PORCINE PANCREAS PLA2 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P00592, ホスホリパーゼA2 |
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#2: 化合物 | ChemComp-CA / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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-試料調製
結晶化 | *PLUS 手法: その他 / 詳細: NMR |
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-解析
NMR software | 名称: Discover / 開発者: BIOSYM / 分類: 精密化 |
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NMRアンサンブル | 登録したコンフォーマーの数: 18 |