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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1sf7 | |||||||||
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タイトル | BINDING OF TETRA-N-ACETYLCHITOTETRAOSE TO HEW LYSOZYME: A POWDER DIFFRACTION STUDY | |||||||||
![]() | LYSOZYME | |||||||||
![]() | HYDROLASE / POWDER DIFFRACTION / RIETVELD REFINEMENT / LYSOZYME | |||||||||
機能・相同性 | ![]() Lactose synthesis / Antimicrobial peptides / Neutrophil degranulation / beta-N-acetylglucosaminidase activity / cell wall macromolecule catabolic process / lysozyme / lysozyme activity / defense response to Gram-negative bacterium / killing of cells of another organism / defense response to Gram-positive bacterium ...Lactose synthesis / Antimicrobial peptides / Neutrophil degranulation / beta-N-acetylglucosaminidase activity / cell wall macromolecule catabolic process / lysozyme / lysozyme activity / defense response to Gram-negative bacterium / killing of cells of another organism / defense response to Gram-positive bacterium / defense response to bacterium / endoplasmic reticulum / extracellular space / identical protein binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | 粉末回折 / ![]() | |||||||||
![]() | Von Dreele, R.B. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Binding of N-acetylglucosamine oligosaccharides to hen egg-white lysozyme: a powder diffraction study. 著者: Von Dreele, R.B. #1: ![]() タイトル: Combined Rietveld and Stereochemical Restraint Refinement of a Protein Crystal Structure 著者: Von Dreele, R.B. #2: ![]() タイトル: The First Protein Crystal Structure Determined from High Resolution X-Ray Powder Diffraction Data: A Variant of the T3R3 Human Insulin Zinc Complex Produced by Grinding 著者: Von Dreele, R.B. / Stephens, P.W. / Blessing, R.H. / Smith, G.D. #3: ![]() タイトル: Binding of N-Acetylglucoasmine to Chicken Egg Lysozyme: A Powder Diffraction Study 著者: Von Dreele, R.B. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 30.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 21.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14331.160 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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#2: 多糖 | 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2- ...2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 粉末回折 |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.108 Å3/Da / 溶媒含有率: 41.19 % |
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結晶化 | 温度: 298 K / 手法: rapid precipitation / pH: 6 詳細: NaCl, Na2HPO4, KH2PO4, tetra-N-acetylchitotetraose, pH 6.0, rapid precipitation, temperature 298K |
結晶化 | *PLUS |
溶液の組成 | *PLUS 濃度: 1.0 M / 詳細: pH6.0 / 化学式: NaCl |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 296 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: CUSTOM-MADE / 検出器: DIFFRACTOMETER / 日付: 2001年7月21日 / 詳細: Ge(111) analyser |
放射 | モノクロメーター: double Si(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.700388 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 3.22→40.13 Å / Num. all: 2255 / Num. obs: 2255 / % possible obs: 100 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 |
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解析
ソフトウェア |
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