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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1sar | ||||||
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タイトル | DETERMINATION AND RESTRAINED LEAST-SQUARES REFINEMENT OF THE CRYSTAL STRUCTURES OF RIBONUCLEASE SA AND ITS COMPLEX WITH 3'-GUANYLIC ACID AT 1.8 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
要素 | RIBONUCLEASE SA | ||||||
キーワード | HYDROLASE (ENDORIBONUCLEASE) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 ribonuclease T1 activity / ribonuclease T1 / RNA endonuclease activity / lyase activity / RNA binding / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Streptomyces aureofaciens (バクテリア) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 1.8 Å | ||||||
データ登録者 | Sevcik, J. / Dodson, E.J. / Dodson, G.G. | ||||||
引用 | ジャーナル: Acta Crystallogr.,Sect.B / 年: 1991 タイトル: Determination and restrained least-squares refinement of the structures of ribonuclease Sa and its complex with 3'-guanylic acid at 1.8 A resolution. 著者: Sevcik, J. / Dodson, E.J. / Dodson, G.G. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1sar.cif.gz | 49.9 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1sar.ent.gz | 39.4 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1sar.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sa/1sar ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/sa/1sar | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: PRO A 27 AND PRO B 27 ARE CIS PROLINES. |
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10584.531 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Streptomyces aureofaciens (バクテリア) 参照: UniProt: P05798, EC: 3.1.4.8 #2: 化合物 | ChemComp-SO4 / | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.33 Å3/Da / 溶媒含有率: 47.15 % |
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-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.8 Å / Num. obs: 17202 / Rmerge(I) obs: 0.056 / Num. measured all: 85946 |
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-解析
ソフトウェア | 名称: PROLSQ / 分類: 精密化 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | Rfactor obs: 0.172 / 最高解像度: 1.8 Å | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: PROLSQ / 分類: refinement | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.8 Å / 最低解像度: 10 Å / Num. reflection obs: 17579 / Rfactor obs: 0.172 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS Biso mean: 16.8 Å2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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