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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1rxa | ||||||||||||||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF R(CCCCGGGG) IN TWO DISTINCT LATTICES | ||||||||||||||||||
要素 | RNA (5'-R(*キーワード | RNA / A-RNA / DOUBLE HELIX | 機能・相同性 | RNA | 機能・相同性情報 手法 | X線回折 / 解像度: 2.9 Å | データ登録者 | Portmann, S. / Usman, N. / Egli, M. | 引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 1995 | タイトル: The crystal structure of r(CCCCGGGG) in two distinct lattices. 著者: Portmann, S. / Usman, N. / Egli, M. 履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1rxa.cif.gz | 13.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1rxa.ent.gz | 7.5 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1rxa.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/rx/1rxa ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/rx/1rxa | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 2556.593 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.61 Å3/Da / 溶媒含有率: 52.86 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 手法: 蒸気拡散法 / pH: 4.5 / 詳細: pH 4.50, VAPOR DIFFUSION | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 |
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結晶化 | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | Ambient temp details: ROOM TEMPERATURE |
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放射光源 | 由来: 回転陽極 / タイプ: ENRAF-NONIUS |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE |
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
-解析
ソフトウェア | 名称: X-PLOR / 分類: 精密化 | ||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2.9→10 Å / σ(F): 2 /
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Refine Biso |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.9→10 Å
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.9 Å / 最低解像度: 10 Å / σ(F): 2 | ||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |