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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1rnc | ||||||
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タイトル | NEWLY OBSERVED BINDING MODE IN PANCREATIC RIBONUCLEASE | ||||||
![]() | RIBONUCLEASE A | ||||||
![]() | HYDROLASE(ENDORIBONUCLEASE) | ||||||
機能・相同性 | ![]() pancreatic ribonuclease / ribonuclease A activity / RNA nuclease activity / nucleic acid binding / lyase activity / defense response to Gram-positive bacterium / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Aguilar, C.F. / Thomas, P.J. / Mills, A. / Moss, D.S. / Palmer, R.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Newly observed binding mode in pancreatic ribonuclease. 著者: Aguilar, C.F. / Thomas, P.J. / Mills, A. / Moss, D.S. / Palmer, R.A. #1: ![]() タイトル: Novel Non-Productively Bound Ribonuclease Inhibitor Complexes-High Resolution X-Ray Refinement Studies on the Binding of Rnase-A to Cytidylyl-2',5'-Guanosine (2',5'Cpg) and ...タイトル: Novel Non-Productively Bound Ribonuclease Inhibitor Complexes-High Resolution X-Ray Refinement Studies on the Binding of Rnase-A to Cytidylyl-2',5'-Guanosine (2',5'Cpg) and Deoxycytidylyl-3',5'-Guanosine (3',5'Dcpdg) 著者: Aguilar, C.F. / Thomas, P.J. / Moss, D.S. / Mills, A. / Palmer, R.A. #2: ![]() タイトル: X-Ray Refinement Study on the Binding of Cytidylic Acid (2'-Cmp) to Ribonuclease-A 著者: Howlin, B. / Harris, G.W. / Moss, D.S. / Palmer, R.A. #3: ![]() タイトル: An X-Ray Refinement Study on the Binding of Ribonuclease-A to Cytidine-N(3)-Oxide 2'-Phosphate 著者: Palmer, R.A. / Moss, D.S. / Haneef, I. / Borkakoti, N. #4: ![]() タイトル: The Refined Structure of Ribonuclease-A at 1.45 Angstroms Resolution 著者: Borkakoti, N. / Moss, D.S. / Stanford, M.J. / Palmer, R.A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 32.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 25 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 752.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 761.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 8.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: RESIDUES PRO 93 AND PRO 114 ARE CIS PROLINES. 2: PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION GLU 111 - GLY 112: 149.724 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13708.326 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-SO4 / |
#3: 化合物 | ChemComp-5GP / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
構成要素の詳細 | THE MOST INTERESTING FEATURE IN THIS STRUCTURE IS THE MODE OF BINDING OF THE CPG INHIBITOR TO THE ...THE MOST INTERESTIN |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.18 Å3/Da / 溶媒含有率: 43.61 % |
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結晶化 | *PLUS 手法: unknown / PH range low: 5.7 / PH range high: 5.2 |
溶液の組成 | *PLUS 濃度: 47 %(v/v) / 一般名: ethanol |
-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 最高解像度: 1.5 Å 詳細: THE INHIBITOR AND SULFATE ANION WERE REFINED USING GROUP OCCUPANCIES.
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.5 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.5 Å / Num. reflection obs: 17855 / Rfactor obs: 0.21 | ||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: p_angle_d / Dev ideal: 1.23 |