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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1rcf | ||||||
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タイトル | STRUCTURE OF THE TRIGONAL FORM OF RECOMBINANT OXIDIZED FLAVODOXIN FROM ANABAENA 7120 AT 1.40 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
![]() | FLAVODOXIN | ||||||
![]() | ELECTRON TRANSFER(FLAVOPROTEIN) | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Burkhart, B. / Ramakrishnan, B. / Yan, H. / Reedstrom, R. / Markley, J. / Straus, N. / Sundaralingam, M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of the trigonal form of recombinant oxidized flavodoxin from Anabaena 7120 at 1.40 A resolution. 著者: Burkhart, B.M. / Ramakrishnan, B. / Yan, H. / Reedstrom, R.J. / Markley, J.L. / Straus, N.A. / Sundaralingam, M. #1: ![]() タイトル: Structure of the Oxidized Long-Chain Flavodoxin from Anabaena 7120 at 2 Angstroms Resolution 著者: Rao, S. / Shaffie, F. / Yu, C. / Satyshur, K. / Stockman, B. / Markley, J. / Sundaralingam, M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 84.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 65.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 747.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 747.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 13 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 19.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 18847.529 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-SO4 / |
#3: 化合物 | ChemComp-FMN / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.41 Å3/Da / 溶媒含有率: 48.91 % | |||||||||||||||||||||||||
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結晶 | *PLUS 溶媒含有率: 46 % | |||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | |||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
反射 | Num. obs: 36069 / % possible obs: 99.1 % |
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反射 | *PLUS 最高解像度: 1.4 Å / 最低解像度: 9999 Å / Rmerge(I) obs: 0.038 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 1.4 Å / 最低解像度: 1.51 Å / % possible obs: 94.3 % / Num. unique obs: 6774 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 最高解像度: 1.4 Å / σ(F): 2 /
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原子変位パラメータ | Biso mean: 17.7 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.11 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.4 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: X-PLOR/SHELXL93 / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.139 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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