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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1rbx | ||||||
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タイトル | RIBONUCLEASE A (E.C.3.1.27.5) CONTROL | ||||||
![]() | RIBONUCLEASE A | ||||||
![]() | HYDROLASE (NUCLEIC ACID / RNA) | ||||||
機能・相同性 | ![]() pancreatic ribonuclease / ribonuclease A activity / RNA nuclease activity / nucleic acid binding / lyase activity / defense response to Gram-positive bacterium / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Dunbar, J.L.H. / Farber, G.K. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The effect of denaturants on protein structure. 著者: Dunbar, J. / Yennawar, H.P. / Banerjee, S. / Luo, J. / Farber, G.K. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 35.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 24.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 407.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 409.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 7.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 10.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO 93 / 2: CIS PROLINE - PRO 114 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13708.326 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.17 Å3/Da / 溶媒含有率: 43.29 % | |||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / pH: 6.8 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | |||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 Å |
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検出器 | タイプ: RIGAKU AFC-5R / 検出器: DIFFRACTOMETER / 日付: 1994年8月2日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.69→30 Å / Num. obs: 11626 / % possible obs: 99 % / Observed criterion σ(I): 4 / 冗長度: 1 % / Rmerge(I) obs: 0.055 |
反射 | *PLUS Num. measured all: 17986 / Rmerge(I) obs: 0.055 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.69→10 Å / σ(F): 2
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原子変位パラメータ | Biso mean: 15.44 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.69→10 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.184 / Rfactor Rwork: 0.184 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS Biso mean: 15.4 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: x_angle_deg / Dev ideal: 1.81 |