ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 1998 タイトル: Solution Structure of an Intramolecular Pyrimidine-Purine-Pyrimidine Triplex Containing an RNA Third Strand 著者: Gotfredsen, C.H. / Schultze, P. / Feigon, J.
分子量: 2508.694 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 詳細: HEXAKIS (ETHYLENE GLYCOL) LINKERS BETWEEN A 8 AND T 9 AND BETWEEN T 16 AND U 17. C 18, C 20, AND C 22 ARE PROTONATED AT N3
#2: DNA鎖
DNA (5'-D(*TP*TP*CP*TP*CP*TP*CP*T)-3')
分子量: 2343.552 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 詳細: HEXAKIS (ETHYLENE GLYCOL) LINKERS BETWEEN A 8 AND T 9 AND BETWEEN T 16 AND U 17. C 18, C 20, AND C 22 ARE PROTONATED AT N3
#3: RNA鎖
RNA (5'-R(*UP*CP*UP*CP*UP*CP*UP*U)-3')
分子量: 2401.417 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 詳細: HEXAKIS (ETHYLENE GLYCOL) LINKERS BETWEEN A 8 AND T 9 AND BETWEEN T 16 AND U 17. C 18, C 20, AND C 22 ARE PROTONATED AT N3
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実験情報
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実験
実験
手法: 溶液NMR
NMR実験
Conditions-ID
Experiment-ID
Solution-ID
タイプ
1
1
1
NOESY
1
2
1
TOCSY
1
3
1
TOCSY-NOESY
1
4
1
HSQC
1
5
1
DQF-COSY
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試料調製
試料状態
pH: 5.7 / 温度: 303 K
結晶化
*PLUS
手法: other / 詳細: NMR
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NMR測定
NMRスペクトロメーター
タイプ
製造業者
モデル
磁場強度 (MHz)
Spectrometer-ID
Bruker DRX500
Bruker
DRX500
500
1
Bruker AMX500
Bruker
AMX500
500
2
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
X-PLOR
3.1
モデル構築
X-PLOR
3.1
精密化
X-PLOR
3.1
位相決定
NMR software
名称
バージョン
開発者
分類
X-PLOR
3.1
BRUNGER
精密化
X-PLOR
3.1
構造決定
精密化
手法: DISTANCE GEOMETRY, SIMULATED ANNEALING / ソフトェア番号: 1 詳細: LAST REFINEMENT STEP USED RELAXATION MATRIX REFINEMENT.
NMRアンサンブル
コンフォーマー選択の基準: LOWEST OVERALL ENERGY / 計算したコンフォーマーの数: 20 / 登録したコンフォーマーの数: 10