- PDB-1r3d: Crystal structure of protein VC1974 from Vibrio cholerae, Pfam ab... -
+
データを開く
IDまたはキーワード:
読み込み中...
-
基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 1r3d
タイトル
Crystal structure of protein VC1974 from Vibrio cholerae, Pfam abhydrolase
要素
conserved hypothetical protein VC1974
キーワード
STRUCTURAL GENOMICS / UNKNOWN FUNCTION / Hydrolase / NYSGXRC / New York SGX Research Center for Structural Genomics / PSI / protein structure initiative
解像度: 1.9→1.97 Å / Rmerge(I) obs: 0.41 / Mean I/σ(I) obs: 6.5 / % possible all: 99.5
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.1.9999
精密化
DENZO
データ削減
SCALEPACK
データスケーリング
SOLVE
位相決定
精密化
構造決定の手法: 単波長異常分散 / 解像度: 1.9→20 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.958 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.942 / SU B: 2.77 / SU ML: 0.085 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.15 / ESU R Free: 0.137 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.21554
1089
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.17932
-
-
-
obs
0.18108
20222
98.25 %
-
all
-
21357
-
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK