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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1qrs | ||||||
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タイトル | GLUTAMINYL-TRNA SYNTHETASE MUTANT D235N COMPLEXED WITH GLUTAMINE TRANSFER RNA | ||||||
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![]() | LIGASE/RNA / AMINOACYL-TRNA SYNTHASE / PROTEIN BIOSYNTHESIS / LIGASE / ATP-B / COMPLEX (AMINOACYL-TRNA SYNTHASE-TRNA) / LIGASE-RNA COMPLEX | ||||||
機能・相同性 | ![]() glutamine-tRNA ligase / glutamine-tRNA ligase activity / glutaminyl-tRNA aminoacylation / glutamyl-tRNA aminoacylation / ATP binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Arnez, J.G. / Steitz, T.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structures of three misacylating mutants of Escherichia coli glutaminyl-tRNA synthetase complexed with tRNA(Gln) and ATP. 著者: Arnez, J.G. / Steitz, T.A. #1: ![]() タイトル: Structural Basis of Anticodon Loop Recognition by Glutaminyl-tRNA Synthetase 著者: Rould, M.A. / Perona, J.J. / Steitz, T.A. #2: ![]() タイトル: Structural Basis for Misaminoacylation by Mutant E. Coli Glutaminyl-tRNA Synthetase Enzymes 著者: Perona, J.J. / Swanson, R.N. / Rould, M.A. / Steitz, T.A. / Soll, D. #3: ![]() タイトル: Structure of E. Coli Glutaminyl-tRNA Synthetase Complexed with tRNA(Gln) and ATP at 2.8 A Resolution 著者: Rould, M.A. / Perona, J.J. / Soll, D. / Steitz, T.A. #4: ![]() タイトル: Transfer RNA Mischarging Mediated by a Mutant Escherichia Coli Glutaminyl-tRNA Synthetase 著者: Inokuchi, H. / Hoben, P. / Yamao, F. / Ozeki, H. / Soll, D. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 181.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 147.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 24060.287 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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#2: タンパク質 | 分子量: 63433.648 Da / 分子数: 1 / Mutation: D235N / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() |
#3: 化合物 | ChemComp-ATP / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.78 Å3/Da / 溶媒含有率: 70 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶 | *PLUS 溶媒含有率: 70 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 17 ℃ / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / PH range low: 7.5 / PH range high: 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
検出器 | タイプ: SDMS / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1990年12月30日 |
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放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 36285 / % possible obs: 91.4 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 3.3 % / Rmerge(I) obs: 0.047 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.6 Å / 最低解像度: 8 Å / % possible obs: 91.4 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 3.3 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.6→6 Å / σ(F): 0 /
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原子変位パラメータ | Biso mean: 31.25 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.4 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.6→6 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.6 Å / 最低解像度: 6 Å / σ(F): 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |