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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1qqg | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF THE PH-PTB TARGETING REGION OF IRS-1 | ||||||
![]() | INSULIN RECEPTOR SUBSTRATE 1 | ||||||
![]() | SIGNAL TRANSDUCTION / BETA-SANDWHICH | ||||||
機能・相同性 | ![]() IRS-related events triggered by IGF1R / IRS-mediated signalling / positive regulation of fatty acid beta-oxidation / insulin receptor complex / positive regulation of glucose metabolic process / Activated NTRK3 signals through PI3K / transmembrane receptor protein tyrosine kinase adaptor activity / Signaling by Leptin / Signaling by LTK / PI3K/AKT activation ...IRS-related events triggered by IGF1R / IRS-mediated signalling / positive regulation of fatty acid beta-oxidation / insulin receptor complex / positive regulation of glucose metabolic process / Activated NTRK3 signals through PI3K / transmembrane receptor protein tyrosine kinase adaptor activity / Signaling by Leptin / Signaling by LTK / PI3K/AKT activation / cellular response to fatty acid / Signaling by ALK / IRS activation / SOS-mediated signalling / PI3K Cascade / positive regulation of glycogen biosynthetic process / negative regulation of insulin secretion / Signal attenuation / phosphatidylinositol 3-kinase binding / signaling adaptor activity / Growth hormone receptor signaling / positive regulation of insulin receptor signaling pathway / negative regulation of insulin receptor signaling pathway / insulin-like growth factor receptor binding / phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signal transduction / phosphotyrosine residue binding / Interleukin-7 signaling / SH2 domain binding / insulin-like growth factor receptor signaling pathway / caveola / positive regulation of glucose import / protein kinase C binding / insulin receptor binding / response to insulin / cytokine-mediated signaling pathway / cellular response to insulin stimulus / Constitutive Signaling by Aberrant PI3K in Cancer / Signaling by ALK fusions and activated point mutants / signaling receptor complex adaptor activity / insulin receptor signaling pathway / PIP3 activates AKT signaling / glucose homeostasis / PI5P, PP2A and IER3 Regulate PI3K/AKT Signaling / RAF/MAP kinase cascade / positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signal transduction / intracellular membrane-bounded organelle / positive regulation of cell population proliferation / signal transduction / nucleoplasm / nucleus / plasma membrane / cytosol / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Dhe-Paganon, S. / Shoelson, S.E. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of the pleckstrin homology-phosphotyrosine binding (PH-PTB) targeting region of insulin receptor substrate 1. 著者: Dhe-Paganon, S. / Ottinger, E.A. / Nolte, R.T. / Eck, M.J. / Shoelson, S.E. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 97.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 74.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 29156.021 Da / 分子数: 2 / 断片: PH-PTB (N-TERMINAL DOMAIN) / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.86 Å3/Da / 溶媒含有率: 56.94 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 294 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8 詳細: 1.7M SODIUM PHOSPHATE, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 21K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1997年6月1日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.3→25 Å / Num. all: 93545 / Num. obs: 91581 / % possible obs: 97.9 % / Observed criterion σ(F): 1 / Observed criterion σ(I): 1 / 冗長度: 3.11 % / Biso Wilson estimate: 35 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.063 / Net I/σ(I): 19.94 |
反射 シェル | 解像度: 2.3→2.4 Å / 冗長度: 3.1 % / Rmerge(I) obs: 0.41 / % possible all: 98.3 |
反射 | *PLUS Num. obs: 29443 / Num. measured all: 91581 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.3→8 Å / σ(F): 2 / σ(I): 2 / 立体化学のターゲット値: ENGH & HUBER
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.3→8 Å
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.3 Å / 最低解像度: 8 Å / σ(F): 2 | ||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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