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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1pp3 | ||||||
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タイトル | Structure of thaumatin in a hexagonal space group | ||||||
![]() | Thaumatin I![]() | ||||||
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機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Charron, C. / Giege, R. / Lorber, B. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of thaumatin in a hexagonal space group: comparison of packing contacts in four crystal lattices. 著者: Charron, C. / Giege, R. / Lorber, B. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 90.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 74 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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詳細 | Two biological units in the asymmetric unit |
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要素
#1: タンパク質 | ![]() 分子量: 22227.059 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.25 Å3/Da / 溶媒含有率: 62.15 % |
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結晶化![]() | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 4.5 詳細: Ammonium sulfate, glycerol, PEG 400, Lithium sulfate, Magnesium sulfate, Sodium acetate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 4 / 検出器: CCD / 日付: 2003年2月22日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 1.6→30 Å / Num. all: 74168 / Num. obs: 74168 / % possible obs: 97.9 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 7.5 % / Rsym value: 0.074 |
反射 シェル | 解像度: 1.6→1.69 Å / Rsym value: 0.215 / % possible all: 99 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]()
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.6→30 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 1.6→1.69 Å |