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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1pjr | ||||||
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タイトル | STRUCTURE OF DNA HELICASE | ||||||
![]() | PCRA | ||||||
![]() | HELICASE / DNA REPAIR / DNA REPLICATION / SOS RESPONSE / ATP-BINDING / DNA-BINDING | ||||||
機能・相同性 | ![]() DNA helicase complex / DNA 3'-5' helicase / recombinational repair / DNA unwinding involved in DNA replication / 3'-5' DNA helicase activity / isomerase activity / ATP hydrolysis activity / DNA binding / ATP binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Subramanya, H.S. / Bird, L.E. / Brannigan, J.A. / Wigley, D.B. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of a DExx box DNA helicase. 著者: Subramanya, H.S. / Bird, L.E. / Brannigan, J.A. / Wigley, D.B. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 142.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 111.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 432.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 448.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 26.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 37.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 82595.102 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: NCA1503 / 遺伝子: PCRA / プラスミド: PET22 / 遺伝子 (発現宿主): PCRA / 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.77 Å3/Da / 溶媒含有率: 67 % | |||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 6.4 / 手法: unknown | |||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 0.87 |
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検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE AREA DETECTOR / 日付: 1996年8月8日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.87 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 40415 / % possible obs: 96.6 % / 冗長度: 2.36 % / Rmerge(I) obs: 0.049 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.5 Å |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 98.8 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.5→10 Å /
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原子変位パラメータ | Biso mean: 37.07 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→10 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: x_angle_deg / Dev ideal: 2.96 |