+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1pag | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | THE 2.5 ANGSTROMS STRUCTURE OF POKEWEED ANTIVIRAL PROTEIN | ||||||
![]() | POKEWEED ANTIVIRAL PROTEIN | ||||||
![]() | PROTEIN SYNTHESIS INHIBITOR | ||||||
機能・相同性 | ![]() rRNA N-glycosylase / rRNA N-glycosylase activity / defense response to virus / toxin activity / negative regulation of translation 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Monzingo, A.F. / Collins, E.J. / Ernst, S.R. / Irvin, J.D. / Robertus, J.D. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The 2.5 A structure of pokeweed antiviral protein. 著者: Monzingo, A.F. / Collins, E.J. / Ernst, S.R. / Irvin, J.D. / Robertus, J.D. #1: ![]() タイトル: Preliminary X-Ray Diffraction Studies on an Anti-Viral Protein 著者: Robertus, J.D. / Monzingo, A.F. / Irvin, J.D. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 110.9 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 85.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
---|
-関連構造データ
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | ![]()
| ||||||||
2 | ![]()
| ||||||||
単位格子 |
| ||||||||
Atom site foot note | 1: RESIDUES PRO A 47 AND PRO B 47 ARE CIS PROLINES. | ||||||||
非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (0.999686, 0.023567, 0.008488), ベクター: |
-
要素
#1: タンパク質 | 分子量: 29341.467 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 参照: UniProt: P10297 #2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
---|
-
試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.26 Å3/Da / 溶媒含有率: 45.6 % | ||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
結晶化 | *PLUS pH: 7.4 / 手法: batch method詳細: Robertus, J.D., (1977) Biochem.Biophys.Res.Comm., 74, 775. | ||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
|
-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
---|---|
放射波長 | 相対比: 1 |
-
解析
ソフトウェア |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | Rfactor Rwork: 0.2 / Rfactor obs: 0.2 / 最高解像度: 2.8 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.8 Å
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
|