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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1pa4 | ||||||
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タイトル | Solution structure of a putative ribosome-binding factor from Mycoplasma pneumoniae (MPN156) | ||||||
![]() | Probable ribosome-binding factor A | ||||||
![]() | STRUCTURAL GENOMICS / UNKNOWN FUNCTION / Ribosome-binding Factor / Distant Homology / BSGC structure funded by NIH / Protein Structure Initiative / PSI / Berkeley Structural Genomics Center | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
![]() | Rubin, S.M. / Pelton, J.G. / Yokota, H. / Kim, R. / Wemmer, D.E. / Berkeley Structural Genomics Center (BSGC) | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Solution structure of a putative ribosome binding protein from Mycoplasma pneumoniae and comparison to a distant homolog. 著者: Rubin, S.M. / Pelton, J.G. / Yokota, H. / Kim, R. / Wemmer, D.E. #1: ![]() タイトル: Solution NMR Structure of Ribosome-binding Factor A (RbfA), a Cold-shock Adaptation Protein from Escherichia Coli 著者: Huang, Y.J. / Swapna, G.V. / Rajan, P.K. / Ke, H. / Xia, B. / Shukla, K. / Inouye, M. / Montelione, G.T. | ||||||
履歴 |
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Remark 650 | HELIX DETERMINATION METHOD: AUTHOR | ||||||
Remark 700 | SHEET DETERMINATION METHOD: AUTHOR |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 501.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 411.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 344.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 543.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 50.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 64.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ | |
その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13413.528 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: MPN156 / プラスミド: pSKB3 / 生物種 (発現宿主): Escherichia coli / 発現宿主: ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: Deposited structures include residues 6-101 |
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試料調製
詳細 |
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試料状態 | イオン強度: 50 mM NaCl / pH: 6.6 / 圧: 1 atm / 温度: 298 K | |||||||||
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1 詳細: Refinement details can be found in the primary citation above. | ||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: fewest violations | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: Submitted conformers are those with lowest DYANA target functions. 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 16 |