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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1onr | ||||||
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タイトル | STRUCTURE OF TRANSALDOLASE B | ||||||
![]() | TRANSALDOLASE B | ||||||
![]() | TRANSFERASE / PENTOSE SHUNT / MULTIGENE FAMILY | ||||||
機能・相同性 | ![]() transketolase or transaldolase activity / transaldolase / transaldolase activity / pentose-phosphate shunt, non-oxidative branch / carbohydrate metabolic process / membrane / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Jia, J. / Huang, W. / Lindqvist, Y. / Schneider, G. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of transaldolase B from Escherichia coli suggests a circular permutation of the alpha/beta barrel within the class I aldolase family. 著者: Jia, J. / Huang, W. / Schorken, U. / Sahm, H. / Sprenger, G.A. / Lindqvist, Y. / Schneider, G. #1: ![]() タイトル: Crystallization and Preliminary X-Ray Crystallographic Analysis of Recombinant Transaldolase B from Escherichia Coli 著者: Jia, J. / Lindqvist, Y. / Schneider, G. / Schorken, U. / Sahm, H. / Sprenger, G.A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 141.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 111.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 418.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 423.3 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 29 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 43 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (1, -0.0054, 0.003), ベクター: |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 35127.965 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.92 Å3/Da / 溶媒含有率: 51.6 % | ||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 293 K / pH: 4 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: Jia, J., (1996) Acta Crystallogr.,Sect.D, 52, 192. | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 |
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検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS II / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1995年1月12日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 62509 / % possible obs: 91.3 % / 冗長度: 7 % / Rmerge(I) obs: 0.064 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.87 Å / Num. measured all: 498214 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 1.87 Å / 最低解像度: 1.97 Å / % possible obs: 82.8 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.87→5.5 Å /
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原子変位パラメータ | Biso mean: 25.1 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.87→5.5 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |