[English] 日本語
Yorodumi- PDB-1ogh: Structure of the bifunctional dCTP deaminase-dUTPase from Methano... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 1ogh | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Title | Structure of the bifunctional dCTP deaminase-dUTPase from Methanocaldococcus jannaschii | ||||||
Components | BIFUNCTIONAL DEAMINASE/DIPHOSPHATASE | ||||||
Keywords | HYDROLASE / BIFUNCTIONAL ENZYME / NUCLEOTIDE METABOLISM / DCTP DEAMINASE / DUTPASE / HOMOTRIMER | ||||||
Function / homology | Function and homology information dCTP deaminase (dUMP-forming) / dCTP deaminase (dUMP-forming) activity / dUTP biosynthetic process / dCTP deaminase activity / dUMP biosynthetic process / nucleotide binding Similarity search - Function | ||||||
Biological species | METHANOCALDOCOCCUS JANNASCHII (archaea) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / SIRAS / Resolution: 1.88 Å | ||||||
Authors | Johansson, E. / Bjornberg, O. / Nyman, P.O. / Larsen, S. | ||||||
Citation | Journal: J.Biol.Chem. / Year: 2003 Title: Structure of the Bifunctional Dctp Deaminase-Dutpase from Methanocaldococcus Jannaschii and its Relation to Other Homotrimeric Dutpases Authors: Johansson, E. / Bjornberg, O. / Nyman, P.O. / Larsen, S. #1: Journal: J.Biol.Chem. / Year: 2003 Title: A Bifunctional Dctp Deaminase-Dutp Nucleotidohydrolase from the Hyperthermophilic Archaeon Methanocaldococcus Jannaschii Authors: Bjornberg, O. / Neuhard, J. / Nyman, P. | ||||||
History |
|
-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
---|
-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 1ogh.cif.gz | 93.7 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
---|---|---|---|---|
PDB format | pdb1ogh.ent.gz | 73.7 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 1ogh.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 1ogh_validation.pdf.gz | 435.4 KB | Display | wwPDB validaton report |
---|---|---|---|---|
Full document | 1ogh_full_validation.pdf.gz | 439.5 KB | Display | |
Data in XML | 1ogh_validation.xml.gz | 19.6 KB | Display | |
Data in CIF | 1ogh_validation.cif.gz | 29.7 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/og/1ogh ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/og/1ogh | HTTPS FTP |
-Related structure data
Similar structure data |
---|
-Links
-Assembly
Deposited unit |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Components on special symmetry positions |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments:
|