登録情報 | データベース: PDB / ID: 1o4y |
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タイトル | THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF BETA-AGARASE A FROM ZOBELLIA GALACTANIVORANS |
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要素 | beta-agarase A |
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キーワード | HYDROLASE / BETA-AGARASE / GLYCOSIDE HYDROLASE FAMILY 16 / AGAROSE DEGRADATION / CLEAVAGE OF BETA-1 / 4-D-GALACTOSE LINKAGES |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
beta-agarase / beta-agarase activity / carbohydrate metabolic process / extracellular region類似検索 - 分子機能 : / Beta-agarase/YXIM esterase-like, galactose-binding domain-like / Beta-agarase / Secretion system C-terminal sorting domain / Secretion system C-terminal sorting domain / Glycosyl hydrolases family 16 / Glycoside hydrolase family 16 / Glycosyl hydrolases family 16 (GH16) domain profile. / Jelly Rolls - #200 / Galactose-binding-like domain superfamily ...: / Beta-agarase/YXIM esterase-like, galactose-binding domain-like / Beta-agarase / Secretion system C-terminal sorting domain / Secretion system C-terminal sorting domain / Glycosyl hydrolases family 16 / Glycoside hydrolase family 16 / Glycosyl hydrolases family 16 (GH16) domain profile. / Jelly Rolls - #200 / Galactose-binding-like domain superfamily / Concanavalin A-like lectin/glucanase domain superfamily / Jelly Rolls / Sandwich / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Zobellia galactanivorans (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 多波長異常分散 / 解像度: 1.48 Å |
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データ登録者 | Allouch, J. / Jam, M. / Helbert, W. / Barbeyron, T. / Kloareg, B. / Henrissat, B. / Czjzek, M. |
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引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2003 タイトル: The Three-dimensional Structures of Two {beta}-Agarases. 著者: Allouch, J. / Jam, M. / Helbert, W. / Barbeyron, T. / Kloareg, B. / Henrissat, B. / Czjzek, M. |
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履歴 | 登録 | 2003年7月29日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2003年12月9日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月26日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.3 | 2023年12月27日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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Remark 999 | sequence the author maintains that the sequence in the sequence database is incorrect |
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