登録情報 | データベース: PDB / ID: 1nzj |
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タイトル | Crystal Structure and Activity Studies of Escherichia Coli Yadb ORF |
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要素 | Hypothetical protein yadB |
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キーワード | STRUCTURAL GENOMICS / UNKNOWN FUNCTION / ZN CLUSTER / GLUTAMYL T-RNA SYNTHETASE |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
合成酵素; C-O結合を形成; アミノアシルtRNAおよび関連化合物を生成するリガーゼ / tRNA wobble base modification / glutamate-tRNA ligase activity / glutamyl-tRNA aminoacylation / zinc ion binding / ATP binding / cytosol類似検索 - 分子機能 Glutamyl-Q tRNA(Asp) synthetase / Glutamyl/glutaminyl-tRNA synthetase / Glutamyl/glutaminyl-tRNA synthetase, class Ib, catalytic domain / tRNA synthetases class I (E and Q), catalytic domain / HUPs / Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Escherichia coli (大腸菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.5 Å |
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データ登録者 | Campanacci, V. / Kern, D.Y. / Becker, H.D. / Spinelli, S. / Valencia, C. / Vincentelli, R. / Pagot, F. / Bignon, C. / Giege, R. / Cambillau, C. |
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引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2004 タイトル: The Escherichia coli YadB gene product reveals a novel aminoacyl-tRNA synthetase like activity. 著者: Campanacci, V. / Dubois, D.Y. / Becker, H.D. / Kern, D. / Spinelli, S. / Valencia, C. / Pagot, F. / Salomoni, A. / Grisel, S. / Vincentelli, R. / Bignon, C. / Lapointe, J. / Giege, R. / Cambillau, C. |
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履歴 | 登録 | 2003年2月18日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2004年4月13日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2008年4月29日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.2 | 2011年7月13日 | Group: Version format compliance |
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改定 1.3 | 2017年10月11日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software / Item: _software.classification / _software.name |
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改定 1.4 | 2023年10月25日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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