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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1nlr | ||||||
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タイトル | ENDO-1,4-BETA-GLUCANASE CELB2, CELLULASE, NATIVE STRUCTURE | ||||||
![]() | ENDO-1,4-BETA-GLUCANASE | ||||||
![]() | ENDOGLUCANASE / GLYCOSYL HYDROLASE / FAMILY 12 / CELB2 | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Sulzenbacher, G. / Dupont, C. / Davies, G.J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The Streptomyces lividans family 12 endoglucanase: construction of the catalytic cre, expression, and X-ray structure at 1.75 A resolution. 著者: Sulzenbacher, G. / Shareck, F. / Morosoli, R. / Dupont, C. / Davies, G.J. #1: ![]() タイトル: Erratum. Structure of the Inhibitory Receptor for Human Natural Killer Cells Resembles Haematopoietic Receptors 著者: Fan, Q.R. / Mosyak, L. / Winter, C.C. / Wagtmann, N. / Long, E.O. / Wiley, D.C. #2: ![]() タイトル: Purification and Characterization of the Celb Endoglucanase from Streptomyces Lividans 66 and DNA Sequence of the Encoding Gene 著者: Wittmann, S. / Shareck, F. / Kluepfel, D. / Morosoli, R. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 56.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 43.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 414.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 415.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 12.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 18.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 24594.713 Da / 分子数: 1 / 断片: CATALYTIC DOMAIN / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 断片: CATALYTIC DOMAIN / 発現宿主: ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
構成要素の詳細 | THE COORDINATES GIVEN DEFINE THE STRUCTURE OF CELB2, THE TRUNCATED, CATALYTICALLY COMPETENT, FORM ...THE COORDINATE |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.01 Å3/Da / 溶媒含有率: 38.2 % | ||||||||||||||||||||
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結晶化 | 手法: 蒸気拡散法 / pH: 4.5 詳細: 30 % PEG 1500, PH 4.5 FOR ACETATE BUFFER METHOD: HANGING DROP VAPOUR DIFFUSION, vapor diffusion | ||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 120 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS IIC / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1997年2月17日 / 詳細: FOCUSING MIRRORS |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.75→15 Å / Num. obs: 18747 / % possible obs: 95.6 % / 冗長度: 6.98 % / Biso Wilson estimate: 18.51 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.047 / Net I/σ(I): 31.4 |
反射 シェル | 解像度: 1.75→1.78 Å / 冗長度: 3.21 % / Rmerge(I) obs: 0.245 / Mean I/σ(I) obs: 5.96 / % possible all: 68.5 |
反射 | *PLUS % possible obs: 93.7 % / 冗長度: 6.77 % |
反射 シェル | *PLUS 最低解像度: 1.84 Å / % possible obs: 67.9 % / 冗長度: 2.78 % / Rmerge(I) obs: 0.287 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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原子変位パラメータ | Biso mean: 20.4 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.75→15 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: REFMAC / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.187 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |