+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ncz | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | TROPONIN C | ||||||
![]() | TROPONIN C | ||||||
![]() | CALCIUM-BINDING PROTEIN / MUSCLE PROTEIN / DUPLICATION | ||||||
機能・相同性 | ![]() Striated Muscle Contraction / troponin complex / skeletal muscle contraction / calcium ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Sundaralingam, M. / Rao, S.T. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: X-ray structures of Mn, Cd and Tb metal complexes of troponin C. 著者: Rao, S.T. / Satyshur, K.A. / Greaser, M.L. / Sundaralingam, M. #1: ![]() タイトル: Structure of Chicken Skeletal Muscle Troponin-C at 1.78 Angstroms Resolution 著者: Satyshur, K.A. / Pyzalska, D. / Rao, S.T. / Greaser, M. / Sundaralingam, M. #2: ![]() タイトル: Refined Structure of Chicken Skeletal Muscle Troponin C in the Two-Calcium State at 2-A Resolution 著者: Satyshur, K.A. / Rao, S.T. / Pyzalska, D. / Drendel, W. / Greaser, M. / Sundaralingam, M. #3: ![]() タイトル: Molecular Structure of Troponin C from Chicken Skeletal Muscle at 3-Angstrom Resolution 著者: Sundaralingam, M. / Bergstrom, R. / Strasburg, G. / Rao, S.T. / Roychowdhury, P. / Greaser, M. / Wang, B.C. #4: ![]() タイトル: X-Ray Diffraction Studies of Troponin-C Crystals from Rabbit and Chicken Skeletal Muscles 著者: Strasburg, G.M. / Greaser, M.L. / Sundaralingam, M. #5: ![]() タイトル: The Amino Acid Sequence of Troponin C from Chicken Skeletal Muscle 著者: Wilkinson, J.M. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 48.1 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 34.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 400 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 401.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 6.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 8.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||
単位格子 |
|
-
要素
#1: タンパク質 | 分子量: 18261.188 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() | ||||
---|---|---|---|---|---|
#2: 化合物 | #3: 化合物 | ChemComp-SO4 / | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
---|
-
試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.14 Å3/Da / 溶媒含有率: 42.47 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
結晶 | *PLUS 溶媒含有率: 43 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS pH: 4.9 / 手法: unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
|
-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 |
---|---|
検出器 | 検出器: AREA DETECTOR |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.8→8 Å / Num. obs: 26721 / % possible obs: 76 % / Observed criterion σ(I): 1.5 / 冗長度: 2.4 % / Rmerge(I) obs: 0.05 |
反射 | *PLUS Num. obs: 11074 / Observed criterion σ(F): 3 / Num. measured all: 26721 |
-
解析
ソフトウェア |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 解像度: 1.8→8 Å / σ(F): 3 /
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 16.9 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.21 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.8→8 Å
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ソフトウェア | *PLUS 名称: PROLSQ / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |