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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1nbr | ||||||
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タイトル | Iron Responsive Element RNA Hairpin, NMR, 15 Structures | ||||||
要素 | RNA HAIRPIN | ||||||
キーワード | RNA / Ribonucleic Acid / Hairpin / Translational Regulation | ||||||
機能・相同性 | RNA / RNA (> 10) 機能・相同性情報 | ||||||
手法 | 溶液NMR | ||||||
データ登録者 | McCallum, S.A. / Pardi, A. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2003 タイトル: Refined Solution Structure of the Iron-responsive Element RNA Using Residual Dipolar Couplings 著者: McCallum, S.A. / Pardi, A. #1: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1997 タイトル: Structure and Dynamics of the Iron Responsive Element RNA: Implications for Binding of the RNA by Iron Regulatory Binding Proteins 著者: Addess, K.J. / Basilion, J.P. / Klausner, R.D. / Rouault, T.A. / Pardi, A. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1nbr.cif.gz | 267.1 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1nbr.ent.gz | 223 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1nbr.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1nbr_validation.pdf.gz | 321 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1nbr_full_validation.pdf.gz | 416.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1nbr_validation.xml.gz | 10.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1nbr_validation.cif.gz | 17.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/nb/1nbr ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/nb/1nbr | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 9292.540 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 詳細: In Vitro Transcription using Synthetic RNA |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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-試料調製
試料状態 | イオン強度: 20 mM Na+ ions / pH: 6.5 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 15 |