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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1nbl | ||||||
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タイトル | NMR Structure of Hellethionin D | ||||||
![]() | Hellethionin D | ||||||
![]() | TOXIN / Gamma Thionins Helleborus | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / distance geometry simulated annealing, molecular dynamics | ||||||
![]() | Milbradt, A.G. / Kerek, F. / Moroder, L. / Renner, C. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural Characterization of Hellethionins from Helleborus purpurascens 著者: Milbradt, A.G. / Kerek, F. / Moroder, L. / Renner, C. | ||||||
履歴 |
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Remark 999 | SEQUENCE THERE WAS NO SUITABLE SEQUENCE DATABASE REFERENCE AT THE TIME OF PROCESSING. |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 253.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 220.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 350.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 433.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 13.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 24.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 4915.618 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: This structure was determined using standard 2D homonuclear techniques. |
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試料調製
詳細 | 内容: 4mM Hellethionin D; water pH 2.5; 90% H2O, 10% D2O / 溶媒系: 90% H2O, 10% D2O pH 2.5 | ||||||||||||||||||||
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試料状態 |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: distance geometry simulated annealing, molecular dynamics ソフトェア番号: 1 詳細: Structure is based on 577 NOE-derived constraints and 17 distance constraints from hydrogen bonds | ||||||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |