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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1mfk | ||||||||||||||||||
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タイトル | Structure of Prokaryotic SECIS mRNA Hairpin | ||||||||||||||||||
![]() | 5'-R(P*![]() RNA / RNA tetraloop / (A/U)GNN tetraloop family / SelB | 機能・相同性 | RNA / RNA (> 10) | ![]() 手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ![]() Fourmy, D. / Guittet, E. / Yoshizawa, S. | ![]() ![]() タイトル: Structure of Prokaryotic SECIS mRNA Hairpin and its Interaction with Elongation Factor SELB 著者: Fourmy, D. / Guittet, E. / Yoshizawa, S. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 284.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 238.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 327.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 434.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 6.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 12.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 7386.423 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 詳細: THE SEQUENCE is from ESCHERICHIA COLI. T7 RNA polymerase in vitro transcription. |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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試料調製
詳細 |
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試料状態 |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: 260 NOE-derived distance constraints, 72 dihedral angle restraints | ||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 200 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |