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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1lzy | |||||||||
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タイトル | X-RAY STRUCTURE OF TURKEY EGG LYSOZYME COMPLEX WITH DI-N-ACETYLCHITOBIOSE. RECOGNITION AND BINDING OF ALPHA-ANOMERIC FORM | |||||||||
![]() | TURKEY EGG WHITE LYSOZYME | |||||||||
![]() | HYDROLASE (O-GLYCOSYL) | |||||||||
機能・相同性 | ![]() glycosaminoglycan binding / cell wall macromolecule catabolic process / lysozyme / lysozyme activity / defense response to Gram-negative bacterium / killing of cells of another organism / defense response to Gram-positive bacterium / extracellular space / identical protein binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() | |||||||||
![]() | Harata, K. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: X-ray structure of monoclinic turkey egg lysozyme at 1.3 A resolution. 著者: Harata, K. #1: ![]() タイトル: X-Ray Structure of Monoclinic Turkey Egg Lysozyme at 1.3 Angstroms Resolution 著者: Harata, K. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 35.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 26.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 757.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 760.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 11.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14228.105 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 組織: EGG WHITE / 参照: UniProt: P00703, lysozyme |
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#2: 多糖 | 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.92 Å3/Da / 溶媒含有率: 36.1 % |
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.55→10 Å / Observed criterion σ(I): 3 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.175 / Rfactor obs: 0.175 / 最高解像度: 1.55 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.55 Å
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拘束条件 |
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