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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1lmp | ||||||||||||
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タイトル | THE CRYSTAL STRUCTURES OF THREE COMPLEXES BETWEEN CHITOOLIGOSACCHARIDES AND LYSOZYME FROM THE RAINBOW TROUT | ||||||||||||
![]() | LYSOZYME | ||||||||||||
![]() | HYDROLASE (O-GLYCOSYL) | ||||||||||||
機能・相同性 | ![]() metabolic process / lysozyme / lysozyme activity / defense response to Gram-negative bacterium / killing of cells of another organism / defense response to Gram-positive bacterium / extracellular space 類似検索 - 分子機能 | ||||||||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||||||||
手法 | ![]() | ||||||||||||
![]() | Karlsen, S. / Hough, E. | ||||||||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structures of three complexes between chito-oligosaccharides and lysozyme from the rainbow trout. How distorted is the NAG sugar in site D? 著者: Karlsen, S. / Hough, E. #1: ![]() タイトル: The Refined Crystal Structure of Lysozyme from Rainbow Trout (Oncorhynchus Mykiss) 著者: Karlsen, S. / Eliassen, B.E. / Hansen, L.Kr. / Larsen, R.L. / Riise, B.W. / Smalaas, A.O. / Hough, E. / Grinde, B. #2: ![]() タイトル: Purification and Characterization of Two Lysozymes from Rainbow Trout (Salmo Gairdneri) 著者: Grinde, B. / Jolles, J. / Jolles, P. | ||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 38.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 28.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 828.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 836.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 10.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 13.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14303.068 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
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#2: 多糖 | 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2- ...2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.2 Å3/Da / 溶媒含有率: 61.55 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / PH range low: 10.5 / PH range high: 9.5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 Å |
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検出器 | タイプ: ENRAF-NONIUS FAST / 検出器: DIFFRACTOMETER / 日付: 1993年8月1日 |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 12175 / % possible obs: 96.9 % / Observed criterion σ(I): 3 / Rmerge(I) obs: 0.033 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2 Å / 最低解像度: 14.67 Å / Rmerge(I) obs: 0.033 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2→8 Å / σ(F): 3 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→8 Å
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拘束条件 |
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