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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ll6 | ||||||
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タイトル | STRUCTURE OF THE D169N MUTANT OF C. IMMITIS CHITINASE 1 | ||||||
![]() | CHITINASE 1 | ||||||
![]() | HYDROLASE / BETA-ALPHA BARREL | ||||||
機能・相同性 | ![]() chitinase / chitinase activity / chitin catabolic process / chitin binding / polysaccharide catabolic process / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Bortone, K. / Monzingo, A.F. / Ernst, S. / Robertus, J.D. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: THE STRUCTURE OF AN ALLOSAMIDIN COMPLEX WITH THE COCCIDIOIDES IMMITIS CHITINASE DEFINES A ROLE FOR A SECOND ACID RESIDUE IN SUBSTRATE-ASSISTED MECHANISM 著者: BORTONE, K. / MONZINGO, A.F. / ERNST, S. / ROBERTUS, J.D. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 304.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 246.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 428.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 472.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 35.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 52.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 43713.824 Da / 分子数: 4 / 断片: RESIDUES 36-427 / 変異: D169N / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.18 Å3/Da / 溶媒含有率: 43.52 % |
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結晶化 | 温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: PEG 4000, ISOPROPANOL, SODIUM HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 123 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: RIGAKU RAXIS IV / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2000年9月3日 |
放射 | モノクロメーター: DOUBLE FOCUSSING MIRRORS (NI & PT) + NI FILTER プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.8→50 Å / Num. all: 34083 / Num. obs: 34083 / % possible obs: 94 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 1.7 % / Rmerge(I) obs: 0.106 / Net I/σ(I): 6.2 |
反射 シェル | 解像度: 2.8→2.9 Å / 冗長度: 1.6 % / Rmerge(I) obs: 0.221 / Mean I/σ(I) obs: 2.4 / Num. unique all: 3261 / % possible all: 89.3 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ID 1LL4 解像度: 2.8→5 Å / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 2 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.8→5 Å
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拘束条件 |
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