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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1lin | ||||||
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タイトル | CALMODULIN COMPLEXED WITH TRIFLUOPERAZINE (1:4 COMPLEX) | ||||||
要素 | CALMODULIN | ||||||
キーワード | CALCIUM-BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 positive regulation of ryanodine-sensitive calcium-release channel activity / negative regulation of ryanodine-sensitive calcium-release channel activity / regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol by sarcoplasmic reticulum / enzyme regulator activity / spindle pole / protein domain specific binding / calcium ion binding / protein-containing complex / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Bos taurus (ウシ) | ||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 解像度: 2 Å | ||||||
データ登録者 | Vandonselaar, M. / Hickie, R.A. / Quail, J.W. / Delbaere, L.T.J. | ||||||
引用 | ジャーナル: Nat.Struct.Biol. / 年: 1994 タイトル: Trifluoperazine-induced conformational change in Ca(2+)-calmodulin. 著者: Vandonselaar, M. / Hickie, R.A. / Quail, J.W. / Delbaere, L.T. #1: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1984 タイトル: Preliminary X-Ray Data for the Calmodulin(Slash)Trifluoperazine Complex 著者: Gehrig, L.M.B. / Delbaere, L.T.J. / Hickie, R.A. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1lin.cif.gz | 46.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1lin.ent.gz | 33 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1lin.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1lin_validation.pdf.gz | 605.7 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1lin_full_validation.pdf.gz | 610.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1lin_validation.xml.gz | 5.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1lin_validation.cif.gz | 8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/li/1lin ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/li/1lin | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 16721.350 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 器官: BRAIN / 参照: UniProt: P62157 | ||||
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#2: 化合物 | ChemComp-CA / #3: 化合物 | ChemComp-TFP / #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 3 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.53 Å3/Da / 溶媒含有率: 51.41 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶 | *PLUS 溶媒含有率: 51 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS pH: 5.5 / 手法: 蒸気拡散法 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 |
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放射光源 |
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検出器 |
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放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray | |||||||||||||||
放射波長 |
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反射 | 解像度: 2→35.1 Å / Num. obs: 12001 / % possible obs: 97.6 % / Observed criterion σ(I): 4 / 冗長度: 3.4 % / Rmerge(I) obs: 0.061 | |||||||||||||||
反射 | *PLUS Rmerge(I) obs: 0.061 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2→10 Å / σ(F): 0 詳細: TEMPERATURE FACTORS FOR THE ATOMS IN RESIDUES 74 - 82 ARE UNUSUALLY HIGH, INDICATING FLEXIBILITY IN THIS REGION.
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原子変位パラメータ | Biso mean: 32.8 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.2 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→10 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: X-PLOR / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |