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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1kj6 | ||||||
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タイトル | Solution Structure of Human beta-Defensin 3 | ||||||
![]() | Beta-defensin 3 | ||||||
![]() | ANTIBIOTIC / defensin / antimicrobial protein / human beta-defensin 3 / beta-defensin / HBD3 | ||||||
機能・相同性 | ![]() CCR6 chemokine receptor binding / Beta defensins / Defensins / killing by host of symbiont cells / antimicrobial humoral response / chemoattractant activity / cell chemotaxis / Golgi lumen / antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide / chemotaxis ...CCR6 chemokine receptor binding / Beta defensins / Defensins / killing by host of symbiont cells / antimicrobial humoral response / chemoattractant activity / cell chemotaxis / Golgi lumen / antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide / chemotaxis / defense response to Gram-negative bacterium / killing of cells of another organism / defense response to Gram-positive bacterium / defense response to bacterium / extracellular space / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / Distance geometry, Simulated Annealing, Molecular Dynamics | ||||||
![]() | Schibli, D.J. / Hunter, H.N. / Aseyev, V. / Starner, T.D. / Wiencek, J.M. / McCray Jr., P.B. / Tack, B.F. / Vogel, H.J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The solution structures of the human beta-defensins lead to a better understanding of the potent bactericidal activity of HBD3 against Staphylococcus aureus. 著者: Schibli, D.J. / Hunter, H.N. / Aseyev, V. / Starner, T.D. / Wiencek, J.M. / McCray Jr., P.B. / Tack, B.F. / Vogel, H.J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 285.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 247.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 342.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 470.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 14.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 23.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 5174.266 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: This structure was determined using standard 2D homonuclear techniques. |
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試料調製
詳細 |
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試料状態 | pH: 4.00 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | |||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | |||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: Distance geometry, Simulated Annealing, Molecular Dynamics ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: closest to the average | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |