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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1kis | ||||||
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タイトル | TAR-TAR "KISSING" HAIRPIN COMPLEX DERIVED FROM THE HIV GENOME, NMR, 1 STRUCTURE | ||||||
要素 |
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キーワード | RNA / RIBONUCLEIC ACID | ||||||
機能・相同性 | RNA / RNA (> 10) 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | synthetic construct (人工物) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Chang, K.Y. / Tinoco Jr, I. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1997 タイトル: The structure of an RNA "kissing" hairpin complex of the HIV TAR hairpin loop and its complement. 著者: Chang, K.Y. / Tinoco Jr., I. #1: ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 1994 タイトル: Characterization of a "Kissing" Hairpin Complex Derived from the Human Immunodeficiency Virus Genome 著者: Chang, K.Y. / Tinoco Jr, I. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1kis.cif.gz | 28.9 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1kis.ent.gz | 19.1 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1kis.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1kis_validation.pdf.gz | 308.4 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1kis_full_validation.pdf.gz | 309.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1kis_validation.xml.gz | 1.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1kis_validation.cif.gz | 2.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ki/1kis ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ki/1kis | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 5168.135 Da / 分子数: 1 / 断片: TRANSCRIPTIONAL ACTIVATION RESPONSE (TAR) REGION / 由来タイプ: 合成 詳細: THE OLIGONUCLEOTIDES WERE SYNTHESIZED ENZYMATICALLY. 由来: (合成) synthetic construct (人工物) |
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#2: RNA鎖 | 分子量: 5073.071 Da / 分子数: 1 / 断片: COMPLEMENTARY LOOP SEQUENCE (TAR*) REGION / 由来タイプ: 合成 詳細: THE OLIGONUCLEOTIDES WERE SYNTHESIZED ENZYMATICALLY. 由来: (合成) synthetic construct (人工物) |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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-試料調製
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
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-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
ソフトウェア |
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NMR software | 名称: X-PLOR / バージョン: 3.1 / 開発者: BRUNGER / 分類: 精密化 | ||||||||||||
精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: simulated annealing-restrained molecular dynamics protocol followed by an energy minimization step | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 17 / 登録したコンフォーマーの数: 1 |