ソフトウェア | 名称 | 分類 |
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DENZO | データ削減 | SCALEPACK | データスケーリング | SHELXL | 精密化 | SHELXL-97 | 精密化 |
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精密化 | 構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 2.4→9 Å / Num. parameters: 848 / Num. restraintsaints: 1140 / 交差検証法: FREE R / σ(F): 4 / 立体化学のターゲット値: ENGH AND HUBER
| Rfactor | 反射数 | %反射 | Selection details |
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Rfree | 0.3091 | 92 | 4.7 % | RANDOM |
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Rwork | 0.239 | - | - | - |
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all | 0.3268 | 1971 | - | - |
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obs | 0.2452 | 1217 | - | - |
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Refine analyze | Num. disordered residues: 0 / Occupancy sum hydrogen: 0 / Occupancy sum non hydrogen: 264 |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.4→9 Å
| タンパク質 | 核酸 | リガンド | 溶媒 | 全体 |
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原子数 | 0 | 224 | 36 | 9 | 269 |
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拘束条件 | Refine-ID | タイプ | Dev ideal |
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X-RAY DIFFRACTION | s_bond_d0.026 | X-RAY DIFFRACTION | s_angle_d0 | X-RAY DIFFRACTION | s_similar_dist0.016 | X-RAY DIFFRACTION | s_from_restr_planes0.0001 | X-RAY DIFFRACTION | s_zero_chiral_vol0 | X-RAY DIFFRACTION | s_non_zero_chiral_vol0 | X-RAY DIFFRACTION | s_anti_bump_dis_restr0.053 | X-RAY DIFFRACTION | s_rigid_bond_adp_cmpnt0 | X-RAY DIFFRACTION | s_similar_adp_cmpnt0.009 | X-RAY DIFFRACTION | s_approx_iso_adps0 | | | | | | | | | | |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.4→2.48 Å / | Rfactor | %反射 |
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Rwork | 0.322 | - |
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obs | - | 95.38 % |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: SHELXL / バージョン: 97 / 分類: refinement |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.4 Å / 最低解像度: 9 Å / % reflection Rfree: 5 % / Rfactor Rfree: 0.3094 / Rfactor Rwork: 0.2385 |
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溶媒の処理 | *PLUS |
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原子変位パラメータ | *PLUS |
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拘束条件 | *PLUS タイプ: s_angle_d |
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