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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1jvw | ||||||
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タイトル | TRYPANOSOMA CRUZI MACROPHAGE INFECTIVITY POTENTIATOR (TCMIP) | ||||||
![]() | MACROPHAGE INFECTIVITY POTENTIATOR | ||||||
![]() | ISOMERASE / Macrophage Infectivity Potentiator / Trypanosoma cruzi / Chagas disease / X-ray crystal structure / rotamase | ||||||
機能・相同性 | ![]() peptidylprolyl isomerase / peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity / chromatin / nucleolus / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Pereira, P.J.B. / Vega, M.C. / Gonzalez-Rey, E. / Fernandez-Carazo, R. / Macedo-Ribeiro, S. / Gomis-Rueth, F.X. / Gonzalez, A. / Coll, M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Trypanosoma cruzi macrophage infectivity potentiator has a rotamase core and a highly exposed alpha-helix. 著者: Pereira, P.J. / Vega, M.C. / Gonzalez-Rey, E. / Fernandez-Carazo, R. / Macedo-Ribeiro, S. / Gomis-Ruth, F.X. / Gonzalez, A. / Coll, M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 50.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 35 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 362.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 364 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 4.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 18863.271 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 発現宿主: ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.13 Å3/Da / 溶媒含有率: 42.14 % | ||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 277 K / 手法: small tubes / pH: 7.5 詳細: PMSF, Tris/HCl, pH 7.5, SMALL TUBES, temperature 277K | ||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / 手法: microdialysis | ||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1997年12月20日 |
放射 | モノクロメーター: SAGITALLY FOCUSED Si(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.885 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.7→19.2 Å / Num. obs: 17009 / % possible obs: 95.9 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 |
反射 シェル | 解像度: 1.7→1.79 Å / % possible all: 89.8 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.7 Å / 冗長度: 3.6 % / Num. measured all: 60547 / Rmerge(I) obs: 0.081 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 1.7 Å / % possible obs: 89.8 % / Rmerge(I) obs: 0.097 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.7→19 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: SHELXL / バージョン: 97 / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS % reflection Rfree: 5 % / Rfactor all: 0.179 / Rfactor Rfree: 0.231 / Rfactor Rwork: 0.176 | ||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |