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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1hhn | ||||||
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タイトル | Calreticulin P-domain | ||||||
要素 | CALRETICULINカルレティキュリン | ||||||
キーワード | MOLECULAR CHAPERONE (シャペロン) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 Calnexin/calreticulin cycle / Scavenging by Class A Receptors / Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC / ER-Phagosome pathway / cytolytic granule / positive regulation of dendritic cell chemotaxis / cortical granule / negative regulation of trophoblast cell migration / negative regulation of retinoic acid receptor signaling pathway / complement component C1q complex binding ...Calnexin/calreticulin cycle / Scavenging by Class A Receptors / Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC / ER-Phagosome pathway / cytolytic granule / positive regulation of dendritic cell chemotaxis / cortical granule / negative regulation of trophoblast cell migration / negative regulation of retinoic acid receptor signaling pathway / complement component C1q complex binding / cellular response to electrical stimulus / endoplasmic reticulum quality control compartment / regulation of meiotic nuclear division / response to glycoside / sarcoplasmic reticulum lumen / hormone binding / nuclear export signal receptor activity / negative regulation of intracellular steroid hormone receptor signaling pathway / : / molecular sequestering activity / cardiac muscle cell differentiation / cortical actin cytoskeleton organization / nuclear androgen receptor binding / cellular response to organic substance / response to testosterone / cellular response to lithium ion / 小胞体 / protein localization to nucleus / negative regulation of neuron differentiation / positive regulation of cell cycle / positive regulation of phagocytosis / : / positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading / protein export from nucleus / positive regulation of endothelial cell migration / acrosomal vesicle / 筋小胞体 / response to organic substance / peptide binding / peptide antigen assembly with MHC class I protein complex / MHC class I peptide loading complex / cellular response to virus / positive regulation of non-canonical NF-kappaB signal transduction / 細胞老化 / unfolded protein binding / integrin binding / フォールディング / response to estradiol / 核膜 / 精子形成 / carbohydrate binding / collagen-containing extracellular matrix / negative regulation of translation / protein stabilization / リボソーム / response to xenobiotic stimulus / iron ion binding / external side of plasma membrane / 小胞体 / mRNA binding / negative regulation of DNA-templated transcription / ubiquitin protein ligase binding / calcium ion binding / positive regulation of cell population proliferation / endoplasmic reticulum membrane / positive regulation of gene expression / perinuclear region of cytoplasm / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / 細胞膜 / 小胞体 / protein-containing complex / extracellular space / 生体膜 / 細胞核 / 細胞質基質 / 細胞質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | RATTUS NORVEGICUS (ドブネズミ) | ||||||
手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ||||||
データ登録者 | Ellgaard, L. / Riek, R. / Herrmann, T. / Guntert, P. / Braun, D. / Helenius, A. / Wuthrich, K. | ||||||
引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2001 タイトル: NMR Structure of the Calreticulin P-Domain 著者: Ellgaard, L. / Riek, R. / Herrmann, T. / Braun, D. / Guntert, P. / Helenius, A. / Wuthrich, K. #1: ジャーナル: FEBS Lett. / 年: 2000 タイトル: Three-Dimensional Structure Topology of the Calreticulin P-Domain Based on NMR Assignment 著者: Ellgaard, L. / Riek, R. / Braun, D. / Herrmann, T. / Helenius, A. / Wuthrich, K. | ||||||
履歴 |
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Remark 650 | HELIX DETERMINATION METHOD: AUTHOR PROVIDED. | ||||||
Remark 700 | SHEET DETERMINATION METHOD: AUTHOR PROVIDED. |
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1hhn.cif.gz | 622.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1hhn.ent.gz | 519.7 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1hhn.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hh/1hhn ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hh/1hhn | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11907.771 Da / 分子数: 1 / 断片: P-DOMAIN RESIDUES 189-288 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) RATTUS NORVEGICUS (ドブネズミ) / 細胞内の位置: ENDOPLASMIC RETICULUM小胞体 / プラスミド: PRSET A / 発現宿主: ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / Variant (発現宿主): PLYSS / 参照: UniProt: P18418 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
試料状態 | pH: 6.3 / 温度: 293 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: その他 / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DRX / 製造業者: Bruker / モデル: DRX / 磁場強度: 800 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1 | |||||||||
NMRアンサンブル | 登録したコンフォーマーの数: 20 |