+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1h72 | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF HOMOSERINE KINASE COMPLEXED WITH HSE | |||||||||
![]() | HOMOSERINE KINASE | |||||||||
![]() | TRANSFERASE / KINASE / THREONINE BIOSYNTHESIS | |||||||||
機能・相同性 | ![]() homoserine kinase / homoserine kinase activity / threonine biosynthetic process / phosphorylation / ATP binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | |||||||||
![]() | Krishna, S.S. / Zhou, T. / Daugherty, M. / Osterman, A.L. / Zhang, H. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural Basis for the Catalysis and Substrate Specificity of Homoserine Kinase 著者: Krishna, S.S. / Zhou, T. / Daugherty, M. / Osterman, A.L. / Zhang, H. #1: ![]() タイトル: Structure and Mechanism of Homoserine Kinase: Prototype for the Ghmp Kinase Superfamily 著者: Zhou, T. / Daugherty, M. / Grishin, N.V. / Osterman, A.L. / Zhang, H. | |||||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 79.5 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 58.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 749.2 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 753.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 9.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 14.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | ![]()
| ||||||||
単位格子 |
| ||||||||
詳細 | THE CHAIN IN THE COMPLEX IS 1422.9TROM **2 |
-
要素
#1: タンパク質 | 分子量: 32299.371 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 発現宿主: ![]() ![]() |
---|---|
#2: 化合物 | ChemComp-HSE / |
#3: 化合物 | ChemComp-ANP / |
#4: 化合物 | ChemComp-TRS / |
#5: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
---|
-
試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.98 Å3/Da / 溶媒含有率: 58.66 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
結晶化 | pH: 8 / 詳細: PEG4000, SODIUM ACETATE, pH 8.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 100 K / pH: 7.2 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
|
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
---|---|
放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | 検出器: IMAGE PLATE |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.9793 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.8→50 Å / Num. obs: 36728 / % possible obs: 99.8 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 5.1 % / Rmerge(I) obs: 0.089 / Net I/σ(I): 21.1 |
反射 | *PLUS Num. measured all: 206493 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 99.9 % / Mean I/σ(I) obs: 2 |
-
解析
ソフトウェア |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 1FWL 解像度: 1.8→50 Å / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 0
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 24.99 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.8→50 Å
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
|