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Open data
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Basic information
| Entry | Database: PDB / ID: 1h4o | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Title | Monoclinic form of human peroxiredoxin 5 | ||||||
Components | PEROXIREDOXIN 5 | ||||||
Keywords | OXIDOREDUCTASE / ANTIOXIDANT ENZYME / THIOREDOXIN PEROTHIOREDOXIN / FOLDXIDASE | ||||||
| Function / homology | Function and homology informationperoxynitrite reductase activity / reactive nitrogen species metabolic process / negative regulation of oxidoreductase activity / negative regulation of transcription by RNA polymerase III / regulation of apoptosis involved in tissue homeostasis / RNA polymerase III transcription regulatory region sequence-specific DNA binding / thioredoxin-dependent peroxiredoxin / thioredoxin peroxidase activity / cysteine-type endopeptidase inhibitor activity involved in apoptotic process / Detoxification of Reactive Oxygen Species ...peroxynitrite reductase activity / reactive nitrogen species metabolic process / negative regulation of oxidoreductase activity / negative regulation of transcription by RNA polymerase III / regulation of apoptosis involved in tissue homeostasis / RNA polymerase III transcription regulatory region sequence-specific DNA binding / thioredoxin-dependent peroxiredoxin / thioredoxin peroxidase activity / cysteine-type endopeptidase inhibitor activity involved in apoptotic process / Detoxification of Reactive Oxygen Species / antioxidant activity / peroxisomal matrix / positive regulation of collagen biosynthetic process / cell redox homeostasis / cellular response to reactive oxygen species / hydrogen peroxide catabolic process / TP53 Regulates Metabolic Genes / peroxidase activity / peroxisome / cellular response to oxidative stress / response to oxidative stress / cytoplasmic vesicle / mitochondrial matrix / inflammatory response / signaling receptor binding / intracellular membrane-bounded organelle / negative regulation of apoptotic process / perinuclear region of cytoplasm / mitochondrion / extracellular space / extracellular exosome / identical protein binding / nucleus / cytoplasm / cytosol Similarity search - Function | ||||||
| Biological species | HOMO SAPIENS (human) | ||||||
| Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / SIR / Resolution: 1.95 Å | ||||||
Authors | Declercq, J.P. / Evrard, C. | ||||||
Citation | Journal: J.Mol.Biol. / Year: 2001Title: Crystal Structure of Human Peroxiredoxin 5, a Novel Type of Mammalian Peroxiredoxin at 1.5 A Resolution Authors: Declercq, J.P. / Evrard, C. / Clippe, A. / Stricht, D.V. / Bernard, A. / Knoops, B. #1: Journal: J.Biol.Chem. / Year: 1999 Title: Cloning and Characterization of Aoeb166, a Novel Mammalian Antioxidant Enzyme of the Peroxiredoxin Family Authors: Knoops, B. / Clippe, A. / Bogard, C. / Arsalane, K. / Wattiez, R. / Hermans, C. / Duconseille, E. / Falmagne, P. / Bernard, A. | ||||||
| History |
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Structure visualization
| Structure viewer | Molecule: Molmil Jmol/JSmol |
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Downloads & links
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| PDBx/mmCIF format | 1h4o.cif.gz | 266.2 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
|---|---|---|---|---|
| PDB format | pdb1h4o.ent.gz | 218.3 KB | Display | PDB format |
| PDBx/mmJSON format | 1h4o.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
| Others | Other downloads |
-Validation report
| Summary document | 1h4o_validation.pdf.gz | 483.8 KB | Display | wwPDB validaton report |
|---|---|---|---|---|
| Full document | 1h4o_full_validation.pdf.gz | 496.6 KB | Display | |
| Data in XML | 1h4o_validation.xml.gz | 60.1 KB | Display | |
| Data in CIF | 1h4o_validation.cif.gz | 86.7 KB | Display | |
| Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/h4/1h4o ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/h4/1h4o | HTTPS FTP |
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HOMO SAPIENS (human)
X-RAY DIFFRACTION
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