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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1h4k | ||||||
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タイトル | Sulfurtransferase from Azotobacter vinelandii in complex with hypophosphite | ||||||
![]() | SULFURTRANSFERASE | ||||||
![]() | TRANSFERASE / SULFUR METABOLISM / THIOSULFATE:CYANIDE | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Bordo, D. / Forlani, F. / Spallarossa, A. / Colnaghi, R. / Carpen, A. / Pagani, S. / Bolognesi, M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: A Persulfurated Cysteine Promotes Active Site Reactivity in Azotobacter Vinelandii Rhodanse 著者: Bordo, D. / Forlani, F. / Spallarossa, A. / Colnaghi, R. / Carpen, A. / Bolognesi, M. / Pagani, S. #1: ![]() タイトル: The Crystal Structure of a Sulfurtransferase from Azotobacter Vinelandii Highliths the Evolutionary Relationship between the Rhodanese and Phosphatase Enzyme Families 著者: Bordo, D. / Deriu, D. / Colnaghi, R. / Carpen, A. / Pagani, S. / Bolognesi, M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 69.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 50.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 446.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 448.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 14.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 20.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 29664.412 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 解説: SYNTHETIC GENE / 細胞内の位置: CYTOPLASM / 遺伝子: RHDA / プラスミド: PQE32 / 細胞内の位置 (発現宿主): CYTOPLASM / 発現宿主: ![]() ![]() | ||||||
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#2: 化合物 | ChemComp-PO2 / | ||||||
#3: 化合物 | #4: 化合物 | #5: 水 | ChemComp-HOH / | 構成要素の詳細 | OTHER_DETAILS: HYPOPHOSPH | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3 Å3/Da / 溶媒含有率: 50 % |
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結晶化 | pH: 6.5 / 詳細: 1.7 M MGSO4, 50 MM MES PH 6.0, 5% (V/V)ETHANEDIOL |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.8349 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.05→30 Å / Num. obs: 18208 / % possible obs: 92.4 % / 冗長度: 5.7 % / Rmerge(I) obs: 0.094 / Rsym value: 0.094 / Net I/σ(I): 10.5 |
反射 シェル | 解像度: 2.05→2.09 Å / 冗長度: 2 % / Rmerge(I) obs: 0.3 / Mean I/σ(I) obs: 3.8 / Rsym value: 0.3 / % possible all: 90.2 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 1E0C 解像度: 2.05→30 Å / σ(F): 0
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.05→30 Å
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拘束条件 |
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Xplor file | Serial no: 1 / Param file: PARAM19X.PRO |