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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1gxj | ||||||
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タイトル | SMC hinge domain from T. maritima w/o coiled coil | ||||||
![]() | CHROMOSOME SEGREGATION SMC PROTEIN | ||||||
![]() | CHROMOSOME SEGREGATION / SMC DIMERISATION DOMAIN / ANTI PARALLEL COILED COIL / SMC PROTEINS | ||||||
機能・相同性 | ![]() cohesin loader activity / chromosome condensation / mitotic sister chromatid cohesion / chromosome segregation / chromosome / double-stranded DNA binding / DNA replication / ATP hydrolysis activity / ATP binding / identical protein binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Lowe, J. / Haering, C. / Nasmyth, K. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Molecular Architecture of Smc Proteins and the Yeast Cohesin Complex 著者: Haering, C. / Lowe, J. / Hochwagen, A. / Nasmyth, K. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 75.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 57.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 437.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 446 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 16.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 22.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 20844.791 Da / 分子数: 2 / 断片: HINGE DOMAIN, RESIDUES 485-670 / 由来タイプ: 組換発現 詳細: HINGE DOMAIN FROM T. MARITIMA, RESIDUES 485-670, MONOCLINIC FORM 由来: (組換発現) ![]() ![]() 株: DSMZ 3109 / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.18 Å3/Da / 溶媒含有率: 45 % | ||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 9.2 / 詳細: pH 9.20 | ||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 19 ℃ / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 9.2 | ||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K | ||||||||||||
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() | ||||||||||||
放射 | プロトコル: MAD / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray | ||||||||||||
放射波長 |
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反射 | 解像度: 2→20 Å / Num. obs: 16848 / % possible obs: 95 % / 冗長度: 2.2 % / Biso Wilson estimate: 37.7 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.072 / Net I/σ(I): 12.2 | ||||||||||||
反射 シェル | 解像度: 2→2.11 Å / 冗長度: 2.2 % / Rmerge(I) obs: 0.185 / Mean I/σ(I) obs: 4.3 / % possible all: 93.7 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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原子変位パラメータ | Biso mean: 45.7 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→20 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS % reflection Rfree: 5 % / Rfactor obs: 0.226 / Rfactor Rfree: 0.267 / Rfactor Rwork: 0.226 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |