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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1gta | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURES OF A SCHISTOSOMAL DRUG AND VACCINE TARGET: GLUTATHIONE S-TRANSFERASE FROM SCHISTOSOMA JAPONICA AND ITS COMPLEX WITH THE LEADING ANTISCHISTOSOMAL DRUG PRAZIQUANTEL | ||||||
![]() | GLUTATHIONE S-TRANSFERASE | ||||||
![]() | GLUTATHIONE TRANSFERASE | ||||||
機能・相同性 | ![]() glutathione transferase / glutathione transferase activity / glutathione metabolic process 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Mctigue, M.A. / Tainer, J.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structures of a schistosomal drug and vaccine target: glutathione S-transferase from Schistosoma japonica and its complex with the leading antischistosomal drug praziquantel. 著者: McTigue, M.A. / Williams, D.R. / Tainer, J.A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 58.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 43.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO 56 / 2: CIS PROLINE - PRO 202 3: HIS 215 - PRO 216 OMEGA = 110.29 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION | ||||||||
詳細 | THE SECOND SUBUNIT OF THE GST DIMER IS GENERATED BY THE SYMMETRY OPERATION Y, X, -Z. |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 25534.723 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() プラスミド: PGEX-3X / 参照: UniProt: P08515, glutathione transferase |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.11 Å3/Da / 溶媒含有率: 60.43 % | ||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 22 ℃ / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5.6 詳細: McTigue, M.A., (1995) Protein struct. func. gen., 22, 55. | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 10832 / Observed criterion σ(F): 2 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.4→7 Å / Rfactor Rwork: 0.197 / Rfactor obs: 0.197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.4→7 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.197 / Rfactor Rwork: 0.197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: x_angle_d / Dev ideal: 4.1 |