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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1gdj | |||||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF FERRIC COMPLEXES OF THE YELLOW LUPIN LEGHEMOGLOBIN WITH ISOQUINOLINE AT 1.8 ANGSTROMS RESOLUTION (RUSSIAN) | |||||||||
![]() | LEGHEMOGLOBIN (DEOXY) | |||||||||
![]() | OXYGEN TRANSPORT | |||||||||
機能・相同性 | ![]() response to nitrate / oxygen carrier activity / oxygen binding / heme binding / nucleus / metal ion binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() | |||||||||
![]() | Harutyunyan, E. / Safonova, T. / Kuranova, I. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: The Structure of Deoxy- and Oxy-Leghaemoglobin from Lupin 著者: Harutyunyan, H.E. / Safonova, T.N. / Kuranova, I.P. / Popov, A.N. / Teplyakov, A.V. / Obmolova, G.V. / Rusakov, A.A. / Vainshtein, B.K. / Dodson, G.G. / Wilson, J.C. / Perutz, M.F. #1: ![]() タイトル: Crystal Structure of Ferric Complexes of the Yellow Lupin Leghemoglobin with Isoquinoline at 1.8 Angstroms Resolution (Russian) 著者: Safonova, T.N. / Teplyakov, A.V. / Obmolova, G.V. / Popov, A.N. / Kuranova, I.P. / Harutyunyan, E.G. #2: ![]() タイトル: X-Ray Structure of Ferrous Complexes of the Yellow Lupin Leghemoglobin with Co and No at 1.8 Angstroms Resolution (Russian) 著者: Obmolova, G.V. / Safonova, T.N. / Teplyakov, A.V. / Popov, A.N. / Kuranova, I.P. / Harutyunyan, E.G. / Vainshtein, B.K. #3: ![]() タイトル: X-Ray Structural Investigation of Leghemoglobin. Vi. Structure of Acetate-Ferrileghemoglobin at a Resolution of 2.0 Angstroms (Russian) 著者: Arutyunyan, E.G. / Kuranova, I.P. / Vainshtein, B.K. / Steigemann, W. #4: ![]() タイトル: X-Ray Structural Investigation of Leghemoglobin. Vi. Structure of Acetate-Ferrileghemoglobin at a Resolution of 2.0 Angstroms 著者: Arutyunyan, E.G. / Kuranova, I.P. / Vainshtein, B.K. / Steigemann, W. #5: ![]() タイトル: X-Ray Diffraction Study of Leghemoglobin. Iv. Determination of the Structure with 2.8 Angstroms Resolution (Russian) 著者: Vainshtein, B.K. / Arutyunyan, E.G. / Kuranova, I.P. / Borisov, V.V. / Sosfenov, N.I. / Pavlovskii, A.G. / Grebenko, A.I. / Nekrasov, Yu.V. #6: ![]() タイトル: X-Ray Structural Investigation of Leghemoglobin. Iv. Structure Determination at a Resolution of 2.8 Angstroms 著者: Vainshtein, B.K. / Arutyunyan, E.G. / Kuranova, I.P. / Borisov, V.V. / Sosfenov, N.I. / Pavlovskii, A.G. / Grebenko, A.I. / Nekrasov, Yu.V. #7: ![]() タイトル: Spatial Structure of Lupine Leghemoglobin with the 2.8 Angstroms Resolution (Russian) 著者: Vainshtein, B.K. / Arutiunian, E.G. / Kuranova, I.P. / Borisov, V.V. / Sosfenov, N.I. / Pavlovskii, A.G. / Grebenko, A.I. / Konareva, N.V. / Nekrasov, Iu.V. #8: ![]() タイトル: Three-Dimensional Structure of Lupine Leghemoglobin with a Resolution of 2.8 Angstroms 著者: Vainshtein, B.K. / Arutyunyan, E.G. / Kuranova, I.P. / Borisov, V.V. / Sosfenov, N.I. / Pavlovskii, A.G. / Grebenko, A.I. / Konareva, N.V. / Nekrasov, Yu.V. #9: ![]() タイトル: X-Ray Structural Study of Leghemoglobin. III. Crystallographic Data on the Structure of the First Component (Russian) 著者: Arutyunyan, E.G. / Kuranova, I.P. / Grebenko, A.I. / Voronova, A.A. #10: ![]() タイトル: X-Ray Structural Study of Leghemoglobin. III. Crystallographic Data Regarding the Structure of the First Component 著者: Arutyunyan, E.G. / Kuranova, I.P. / Grebenko, A.I. / Voronova, A.A. #11: ![]() タイトル: The Haem-Accessibility in Leghaemoglobin of Lupinus Luteus as Observed by Proton Magnetic Relaxation 著者: Vuk-Pavlovic, S. / Benko, B. / Maricic, S. / Lahajnar, G. / Kuranova, I.P. / Vainshtein, B.K. #12: ![]() タイトル: X-Ray Study of Leghemoglobin. II. Determination of the Structure with Resolution of 5 Angstroms 著者: Vainshtein, B.K. / Arutyunyan, E.G. / Kuranova, I.P. / Borisov, V.V. / Sosfenov, N.I. / Pavlovskii, A.G. / Grebenko, A.I. / Konareva, N.V. #13: ![]() タイトル: X-Ray Study of Leghemoglobin. I.Purification, Crystallization, and Preparation of Derivatives Containing Heavy Atoms 著者: Vainshtein, B.K. / Arutyunyan, E.G. / Kuranova, I.P. / Borisov, V.V. / Sosfenov, N.I. / Pavlovskii, A.G. / Grebenko, A.I. / Konareva, N.V. #14: ![]() タイトル: Structure of Leghaemoglobin from Lupin Root Nodules at 5 Angstroms Resolution 著者: Vainshtein, B.K. / Harutyunyan, E.H. / Kuranova, I.P. / Borisov, V.V. / Sosfenov, N.I. / Pavlovsky, A.G. / Grebenko, A.I. / Konareva, N.V. #15: ![]() タイトル: The X-Ray Structural Study of Leghemoglobin. II. Determination of the Structure at 5 Angstroms Resolution (Russian) 著者: Vainshtein, B.K. / Arutyunyan, E.G. / Kuranova, I.P. / Borisov, V.V. / Sosfenov, N.I. / Pavlovskii, A.G. / Grebenko, A.I. / Konareva, N.V. #16: ![]() タイトル: The X-Ray Structural Study of Leghemoglobin. I. Purification, Crystallization, and Production of Derivatives Containing Heavy Atoms (Russian) 著者: Vainshtein, B.K. / Arutyunyan, E.G. / Kuranova, I.P. / Borisov, V.V. / Sosfenov, N.I. / Pavlovskii, A.G. / Grebenko, A.I. / Konareva, N.V. #17: ![]() タイトル: X-Ray Determination of Three-Dimensional Structure of Leghemoglobin from Lupinus Luteus L. At 5 Angstroms Resolution (Russian) 著者: Vainshtein, B.K. / Arutiunian, E.G. / Kuranova, I.P. / Borisov, V.V. / Sosfenov, N.I. / Pavlovskii, A.G. / Grebenko, A.I. / Konareva, N.V. #18: ![]() タイトル: X-Ray Diffraction Determination of the Three-Dimensional Structure of Leghemoglobin of Lupinus Luteus L. With 5 Angstroms Resolution 著者: Vainshtein, B.K. / Arutyunyan, E.G. / Kuranova, I.P. / Borisov, V.V. / Sosfenov, N.I. / Pavlovskii, A.G. / Grebenko, A.I. / Konareva, N.V. #19: ![]() タイトル: Cell Parameters of Crystalline Plant (Lupinus Luteus (Lupine)) Hemoglobin (Russian) 著者: Arutyunyan, E.G. / Zaitsev, V.N. / Zhiznevskaya, G.Ya. / Borodenko, L.I. #20: ![]() タイトル: Unit-Cell Parameters of Crystalline Plant Hemoglobin 著者: Arutyunyan, E.G. / Zaitsev, V.N. / Zhiznevskaya, G.Ya. / Borodenko, L.I. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 50.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 469.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 475.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 6.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 9.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 16674.070 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 参照: UniProt: P02240 |
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#2: 化合物 | ChemComp-HEM / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.74 Å3/Da / 溶媒含有率: 55.09 % |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: none |
-データ収集
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.7 Å / 最低解像度: 8.3 Å / Num. obs: 14374 / % possible obs: 94 % / Observed criterion σ(F): 3 / Rmerge(I) obs: 0.05 |
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解析
ソフトウェア | 名称: PROLSQ / 分類: 精密化 | ||||||||||||
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精密化 | 解像度: 1.7→8 Å / σ(F): 1 詳細: THE FIRST AND LAST RESIDUES OF THE PROTEIN CHAIN ARE POORLY REVEALED IN THE ELECTRON DENSITY SYNTHESIS.
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.7→8 Å
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拘束条件 | *PLUS タイプ: p_bond_d / Dev ideal: 0.021 |