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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1fxr | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF THE FERREDOXIN I FROM DESULFOVIBRIO AFRICANUS AT 2.3 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
![]() | FERREDOXIN I | ||||||
![]() | ELECTRON TRANSPORT | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Frey, M. / Roth, M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of the ferredoxin I from Desulfovibrio africanus at 2.3 A resolution. 著者: Sery, A. / Housset, D. / Serre, L. / Bonicel, J. / Hatchikian, C. / Frey, M. / Roth, M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 38 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 26.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 401 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 401 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 4.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 6.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (-0.999092, 0.042575, 0.00141), ベクター: |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 7206.928 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 参照: UniProt: P00210 #2: 化合物 | #3: 化合物 | ChemComp-SO4 / | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.01 Å3/Da / 溶媒含有率: 38.93 % | ||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 5 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.5 Å / % possible obs: 70.6 % / Rmerge(I) obs: 0.086 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.3→10 Å / σ(F): 2 /
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Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.22 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.3→10 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.182 / Rfactor Rfree: 0.227 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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