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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1frp | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF FRUCTOSE-1,6-BISPHOSPHATASE COMPLEXED WITH FRUCTOSE-2,6-BISPHOSPHATE, AMP AND ZN2+ AT 2.0 ANGSTROMS RESOLUTION. ASPECTS OF SYNERGISM BETWEEN INHIBITORS | ||||||
![]() | FRUCTOSE 1,6-BISPHOSPHATASE | ||||||
![]() | HYDROLASE(PHOSPHORIC MONOESTER) | ||||||
機能・相同性 | ![]() Gluconeogenesis / sucrose biosynthetic process / fructose-bisphosphatase / fructose 1,6-bisphosphate 1-phosphatase activity / cellular response to magnesium ion / negative regulation of Ras protein signal transduction / fructose 6-phosphate metabolic process / fructose metabolic process / monosaccharide binding / negative regulation of glycolytic process ...Gluconeogenesis / sucrose biosynthetic process / fructose-bisphosphatase / fructose 1,6-bisphosphate 1-phosphatase activity / cellular response to magnesium ion / negative regulation of Ras protein signal transduction / fructose 6-phosphate metabolic process / fructose metabolic process / monosaccharide binding / negative regulation of glycolytic process / fructose 1,6-bisphosphate metabolic process / regulation of gluconeogenesis / AMP binding / dephosphorylation / gluconeogenesis / negative regulation of cell growth / cellular response to xenobiotic stimulus / identical protein binding / metal ion binding / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Xue, Y. / Huang, S. / Liang, J.-Y. / Zhang, Y. / Lipscomb, W.N. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of fructose-1,6-bisphosphatase complexed with fructose 2,6-bisphosphate, AMP, and Zn2+ at 2.0-A resolution: aspects of synergism between inhibitors. 著者: Xue, Y. / Huang, S. / Liang, J.Y. / Zhang, Y. / Lipscomb, W.N. #1: ![]() タイトル: Crystallographic Studies of the Catalytic Mechanism of the Neutral Form of Fructose-1,6-Bisphosphatase 著者: Zhang, Y. / Liang, J.-Y. / Huang, S. / Ke, H. / Lipscomb, W.N. #2: ![]() タイトル: Crystal Structure of the Neutral Form of Fructose 1,6-Bisphosphatase Complexed with Regulatory Inhibitor Fructose 2,6-Bisphosphate at 2.6 Angstroms Resolution 著者: Liang, J.-Y. / Huang, S. / Zhang, Y. / Ke, H. / Lipscomb, W.N. #3: ![]() タイトル: Conformational Transition of Fructose 1,6-Bisphosphatase: Structure Comparison between the AMP Complex (T Form) and the Fructose 6-Phosphate Complex (R Form) 著者: Ke, H. / Liang, J.-Y. / Zhang, Y. / Lipscomb, W.N. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 172.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 138.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 2 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 2 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 28.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 39.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 36487.000 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #2: 糖 | #3: 化合物 | #4: 化合物 | #5: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.78 Å3/Da / 溶媒含有率: 55.7 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 7.4 / 詳細: pH 7.4, ROOM TEMPERATURE, COCRYSTALLIZATION. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 20 ℃ / 手法: microdialysis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 49540 / % possible obs: 82.8 % |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2 Å / 最低解像度: 15 Å / Num. measured all: 115147 / Rmerge(I) obs: 0.074 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2→10 Å / σ(F): 2 /
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原子変位パラメータ | Biso mean: 30.52 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine analyze | Luzzati coordinate error obs: 0.25 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→10 Å
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拘束条件 |
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