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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1fia | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF THE FACTOR FOR INVERSION STIMULATION FIS AT 2.0 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
![]() | FACTOR FOR INVERSION STIMULATION (FIS) | ||||||
![]() | DNA BINDING PROTEIN / DNA-BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() invertasome / positive regulation of DNA recombination / sequence-specific DNA binding, bending / provirus excision / nucleoid / DNA-binding transcription repressor activity / DNA-binding transcription activator activity / chromosome organization / core promoter sequence-specific DNA binding / protein-DNA complex ...invertasome / positive regulation of DNA recombination / sequence-specific DNA binding, bending / provirus excision / nucleoid / DNA-binding transcription repressor activity / DNA-binding transcription activator activity / chromosome organization / core promoter sequence-specific DNA binding / protein-DNA complex / response to radiation / nucleosome / sequence-specific DNA binding / transcription cis-regulatory region binding / DNA-templated transcription / regulation of DNA-templated transcription / protein homodimerization activity / DNA binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Kostrewa, D. / Granzin, J. / Choe, H.-W. / Labahn, J. / Saenger, W. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of the factor for inversion stimulation FIS at 2.0 A resolution. 著者: Kostrewa, D. / Granzin, J. / Stock, D. / Choe, H.W. / Labahn, J. / Saenger, W. #1: ![]() タイトル: Three-Dimensional Structure of the E. Coli DNA-Binding Protein FIS 著者: Kostrewa, D. / Granzin, J. / Koch, C. / Choe, H.-W. / Raghunathan, S. / Wolf, W. / Labahn, J. / Kahmann, R. / Saenger, W. #2: ![]() タイトル: Crystallization of the DNA-Binding Escherichia Coli Protein FIS 著者: Choe, H.-W. / Labahn, J. / Itoh, S. / Koch, C. / Kahmann, R. / Saenger, W. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 43.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 31.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: RESIDUES VAL 10 AND LYS 25 IN BOTH CHAINS WERE MODELLED AS ALANINE. |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11252.918 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | 構成要素の詳細 | HELICES C AND D OF EACH CHAIN FORM THE HELIX-TURN-HELIX MOTIF FOR DNA BINDING. | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.14 Å3/Da / 溶媒含有率: 42.46 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 8.2 / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2 Å / Num. all: 12719 / Num. obs: 8221 / % possible obs: 92 % / Num. measured all: 44050 |
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解析
ソフトウェア | 名称: TNT / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | Rfactor obs: 0.192 / 最高解像度: 2 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS Num. reflection all: 12719 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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