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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1f7x | ||||||
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タイトル | SOLUTION STRUCTURE OF C-TERMINAL DOMAIN ZIPA | ||||||
要素 | CELL DIVISION PROTEIN ZIPA | ||||||
キーワード | CELL CYCLE / Alpha-Beta fold / cell division / septation / transmembrane / inner membrane | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 divisome complex / FtsZ-dependent cytokinesis / division septum assembly / cell division site / cell division / protein homodimerization activity / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Escherichia coli (大腸菌) | ||||||
手法 | 溶液NMR / distance geometry simulated annealing | ||||||
Model type details | minimized average | ||||||
データ登録者 | Moy, F.J. / Glasfeld, E. / Mosyak, L. / Powers, R. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 2000 タイトル: Solution structure of ZipA, a crucial component of Escherichia coli cell division. 著者: Moy, F.J. / Glasfeld, E. / Mosyak, L. / Powers, R. #1: ジャーナル: J. Biomol. NMR / 年: 2000 タイトル: Letter to the editor: 1H, 15N, 13C, and 13CO assignments and secondary structure determination of ZipA. 著者: Moy, F.J. / Glasfeld, E. / Powers, R. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1f7x.cif.gz | 1.3 MB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1f7x.ent.gz | 1.1 MB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1f7x.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1f7x_validation.pdf.gz | 347.6 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1f7x_full_validation.pdf.gz | 528.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1f7x_validation.xml.gz | 86.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1f7x_validation.cif.gz | 112.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/f7/1f7x ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/f7/1f7x | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 16135.430 Da / 分子数: 1 / 断片: C-TERMINAL DOMAIN / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Escherichia coli (大腸菌) / プラスミド: PEG041 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P77173 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: The structure was determined using triple-resonance NMR spectroscopy. |
-試料調製
詳細 |
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試料状態 |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DRX / 製造業者: Bruker / モデル: DRX / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: distance geometry simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: The structures are based on a total of 2758 restraints, 2038 are NOE-derived distance constraints, 377 dihedral angle restraints, 84 distance restraints from hydrogen bonds, 113 3JNHa ...詳細: The structures are based on a total of 2758 restraints, 2038 are NOE-derived distance constraints, 377 dihedral angle restraints, 84 distance restraints from hydrogen bonds, 113 3JNHa coupling restraints, 230 secondary Ca/Cb chemical shift restraints, and a conformational database. | ||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: minimized average structure | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with acceptable covalent geometry,structures with favorable non-bond energy,structures with the least restraint violations,structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 30 |