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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1exr | ||||||
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タイトル | THE 1.0 ANGSTROM CRYSTAL STRUCTURE OF CA+2 BOUND CALMODULIN | ||||||
![]() | CALMODULIN | ||||||
![]() | METAL TRANSPORT / CALMODULIN / HIGH RESOLUTION / DISORDER | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Wilson, M.A. / Brunger, A.T. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The 1.0 A crystal structure of Ca(2+)-bound calmodulin: an analysis of disorder and implications for functionally relevant plasticity 著者: Wilson, M.A. / Brunger, A.T. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 94.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 72.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 16687.420 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() プラスミド: PKK233-3 / 発現宿主: ![]() ![]() | ||
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#2: 化合物 | ChemComp-CA / #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.99 Å3/Da / 溶媒含有率: 40 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 278 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5 詳細: MPD, calcium chloride, sodium cacodylate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 4 / 検出器: CCD / 日付: 1999年7月21日 / 詳細: MIRROR |
放射 | モノクロメーター: DOUBLE CRYSTAL / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.886 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1→50 Å / Num. obs: 78247 / % possible obs: 96.9 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 5.4 % / Rmerge(I) obs: 0.073 / Net I/σ(I): 17.4 |
反射 シェル | 解像度: 1→1.04 Å / 冗長度: 3.3 % / Rmerge(I) obs: 0.506 / Mean I/σ(I) obs: 2.1 / % possible all: 83.9 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1 Å / 最低解像度: 50 Å / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 5.4 % |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 83.9 % / 冗長度: 3.3 % / Num. unique obs: 6757 / Mean I/σ(I) obs: 2.1 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: UNPUBLISHED 1.1 A PARAMECIUM TETRAURELIA CALMODULIN 解像度: 1→500 Å / Num. parameters: 14894 / Num. restraintsaints: 22732 / 交差検証法: FREE R / σ(F): 0 / 立体化学のターゲット値: ENGH AND HUBER 詳細: ANISOTROPIC REFINEMENT REDUCED FREE R (NO CUTOFF) BY 9%
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溶媒の処理 | 溶媒モデル: MOEWS & KRETSINGER, J.MOL.BIOL.91 (1973)201-228 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine analyze | Num. disordered residues: 36 / Occupancy sum hydrogen: 1089 / Occupancy sum non hydrogen: 1327 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1→500 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: SHELXL-97 / 分類: refinement | |||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最低解像度: 50 Å / Rfactor all: 0.1368 / Rfactor obs: 0.1345 / Rfactor Rwork: 0.134 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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