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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1.0E+95 | ||||||||||||||||||||
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タイトル | Solution structure of the pseudoknot of SRV-1 RNA, involved in ribosomal frameshifting | ||||||||||||||||||||
![]() | RNA (5'-(*![]() RNA / RIBONUCLEIC ACID / SRV-1 / PSEUDOKNOT / FRAMESHIFT | 機能・相同性 | : / RNA / RNA (> 10) | ![]() 生物種 | ![]() 手法 | 溶液NMR / torsion angle dynamics | ![]() Michiels, P.J.A. / Versleyen, A. / Pleij, C.W.A. / Hilbers, C.W. / Heus, H.A. | ![]() ![]() タイトル: Solution Structure of the Pseudoknot of Srv-1 RNA, Involved in Ribosomal Frameshifting 著者: Michiels, P.J.A. / Versleijen, A.A. / Verlaan, P.W. / Pleij, C.W.A. / Hilbers, C.W. / Heus, H.A. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 339.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 285 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 327.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 427 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 13.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 23.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 11585.017 Da / 分子数: 1 / 断片: GAG-PRO FRAMESHIFTING PSEUDOKNOT / 変異: YES / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) ![]() |
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構成要素の詳細 | CHAIN A ENGINEERED |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
試料状態 | イオン強度: 100 MM NACL, 10 MM K2HPO4/KH2PO4 / pH: 6.4 / 温度: 303 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: torsion angle dynamics / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LEAST RESTRAINT VIOLATIONS, LOWEST ENERGY 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 15 |