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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1e4y | ||||||
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タイトル | Mutant P9L of adenylate kinase from E. coli, modified in the Gly-loop | ||||||
![]() | Adenylate kinase![]() | ||||||
![]() | TRANSFERASE(PHOSPHOTRANSFERASE) | ||||||
機能・相同性 | ![]() purine ribonucleotide interconversion / ADP biosynthetic process / nucleoside monophosphate metabolic process / CDP biosynthetic process / (d)CMP kinase activity / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Mueller, C.W. / Schulz, G.E. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structures of two mutants of adenylate kinase from Escherichia coli that modify the Gly-loop. 著者: Muller, C.W. / Schulz, G.E. #1: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1990 タイトル: Induced-Fit Movements in Adenylate Kinases 著者: Schulz, G.E. / Mueller, C.W. / Diederichs, K. #2: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1988 タイトル: Structure of the Complex of Adenylate Kinase from Escherichia Coli with the Inhibitor P1, P5-Bis (Adenosine-5'-) Pentaphosphate 著者: Mueller, C.W. / Schulz, G.E. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 94.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 73 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (-0.995341, 0.068333, 0.068023), ベクター ![]() |
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要素
#1: タンパク質 | ![]() 分子量: 23678.150 Da / 分子数: 2 / 変異: L9P / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: AP5A / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | 構成要素の詳細 | CHAIN A, B ENGINEERED | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.85 Å3/Da / 溶媒含有率: 56.84 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化![]() | pH: 7.2 / 詳細: pH 7.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 20 ℃ / pH: 6.7 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 279 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 3.4→10 Å / Num. obs: 7261 / % possible obs: 90 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 2 % / Rmerge(I) obs: 0.1 / Rsym value: 0.1 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]()
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.85→10 Å
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拘束条件 |
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