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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1dcl | ||||||
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タイトル | MCG, A LAMBDA V TYPE LIGHT-CHAIN DIMER (BENCE-JONES PROTEIN), CRYSTALLIZED FROM AMMONIUM SULFATE | ||||||
![]() | MCG | ||||||
![]() | IMMUNOGLOBULIN / BENCE JONES / ANTIBODY / MULTIPLE QUATERNARY STRUCTURES | ||||||
機能・相同性 | ![]() CD22 mediated BCR regulation / immunoglobulin complex / Fc epsilon receptor (FCERI) signaling / Classical antibody-mediated complement activation / Initial triggering of complement / FCGR activation / Role of phospholipids in phagocytosis / Role of LAT2/NTAL/LAB on calcium mobilization / Scavenging of heme from plasma / FCERI mediated Ca+2 mobilization ...CD22 mediated BCR regulation / immunoglobulin complex / Fc epsilon receptor (FCERI) signaling / Classical antibody-mediated complement activation / Initial triggering of complement / FCGR activation / Role of phospholipids in phagocytosis / Role of LAT2/NTAL/LAB on calcium mobilization / Scavenging of heme from plasma / FCERI mediated Ca+2 mobilization / FCGR3A-mediated IL10 synthesis / Antigen activates B Cell Receptor (BCR) leading to generation of second messengers / Regulation of Complement cascade / Cell surface interactions at the vascular wall / FCERI mediated MAPK activation / FCGR3A-mediated phagocytosis / antigen binding / Regulation of actin dynamics for phagocytic cup formation / FCERI mediated NF-kB activation / Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell / adaptive immune response / Potential therapeutics for SARS / immune response / extracellular space / extracellular region / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Schiffer, M. / Xu, Z.B. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Three-dimensional structure of a light chain dimer crystallized in water. Conformational flexibility of a molecule in two crystal forms. 著者: Ely, K.R. / Herron, J.N. / Harker, M. / Edmundson, A.B. #1: ![]() 年: 1988 タイトル: The Refinement and Structure of Mcg Bence-Jones Dimer at 2.3 Angstroms Resolution 著者: Xu, Z.B. / Schiffer, M. #2: ![]() タイトル: Structure of a Lambda-Type Bence-Jones Protein at 3.5-A Resolution 著者: Schiffer, M. / Girling, R.L. / Ely, K.R. / Edmundson, A.B. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 101.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 78.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 428.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 464.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 26.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 38.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: 抗体 | 分子量: 22818.096 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: A LAMBDA V TYPE LIGHT-CHAIN DIMER / 由来: (天然) ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.07 Å3/Da / 溶媒含有率: 59.95 % | ||||||||||||||||||
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結晶化 | 詳細: CRYSTALLIZED FROM AMMONIUM SULFATE | ||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / 手法: microdialysis / 詳細: Abola, E.E., (1980) Biochemistry, 19, 432. | ||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
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解析
ソフトウェア | 名称: PROLSQ / 分類: 精密化 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.14 / 最高解像度: 2.3 Å | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.3 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.14 / Rfactor Rwork: 0.14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |